RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBCBQ99426 244 aa9.76□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SEMA3CQ99985 751 aa9.76□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ORAI3Q9BRQ5 295 aa9.76□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HERPUD2Q9BSE4 406 aa9.76□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VIPAS39Q9H9C1 493 aa9.76□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EPB41L5Q9HCM4 733 aa9.76□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PNPLA8Q9NP80 782 aa9.76□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AMACRQ9UHK6 382 aa9.76□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.76□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ICE1Q9Y2F5 2266 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HHLA1C9JL84 531 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TTI1O43156 1089 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPFIA2O75334 1257 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CSO75390 466 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRT1P04264 644 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WNT1P04628 370 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM200BP0CF97 657 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IRF1P10914 325 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RALAP11233 206 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SFTPCP11686 197 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TYRP14679 529 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACP1P24666 158 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MIPP30301 263 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARSEP51690 589 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SKOR1P84550 965 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DR1Q01658 176 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GUCY2DQ02846 1103 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NUMA1Q14980 2115 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BOLA3Q53S33 107 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TFDP3Q5H9I0 405 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C3orf38Q5JPI3 329 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TTC27Q6P3X3 843 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MFSD7Q6UXD7 560 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TPGS1Q6ZTW0 290 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HDXQ7Z353 690 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BNIPLQ7Z465 357 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 JAMLQ86YT9 394 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM71BQ8TC56 605 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TEKT4Q8WW24 435 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RAPGEF5Q92565 580 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BHMTQ93088 406 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NT5C3BQ969T7 300 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMARCD1Q96GM5 515 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC6A18Q96N87 628 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMOQ99835 787 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ERP44Q9BS26 406 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BBS2Q9BXC9 721 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM129AQ9BZQ8 928 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DCLK3Q9C098 648 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RAB17Q9H0T7 212 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM114A2Q9NRY5 505 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SATB2Q9UPW6 733 aa9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLDN5O00501 218 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MDM4O15151 490 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CACNG3O60359 315 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HSF2BPO75031 334 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DAB1O75553 588 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AP1G2O75843 785 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SASH3O75995 380 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BEST1O76090 585 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TJP3O95049 919 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SEMA4FO95754 770 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CISD3P0C7P0 127 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DESP17661 470 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KDELR1P24390 212 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ECHS1P30084 290 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SDC4P31431 198 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SSR1P43307 286 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CARSP49589 748 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DGKGP49619 791 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 INHBCP55103 352 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TAF10Q12962 218 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CASP8Q14790 479 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TAF5Q15542 800 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDCP2Q5VXM1 449 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF787Q6DD87 383 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PM20D1Q6GTS8 502 aa9.74□□□□□ -0.85
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64 ms