RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 RETP07949 1114 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SETSIPP0DME0 302 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 FGFR1P11362 822 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 VDRP11473 427 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 FGFR4P22455 802 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 RRM1P23921 792 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 LRPAP1P30533 357 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CXCR5P32302 372 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 C2orf54Q08AI8 447 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 PTP4A2Q12974 167 aa6.81□□□□□ -1.32
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CCL20-202ENST00000409189 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.81□□□□□ -1.32
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CCL20-202ENST00000409189 ALKAL1Q6UXT8 129 aa6.81□□□□□ -1.32
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CCL20-202ENST00000409189 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CD101Q93033 1021 aa6.81□□□□□ -1.32
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CCL20-202ENST00000409189 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6.81□□□□□ -1.32
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CCL20-202ENST00000409189 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 PARVAQ9NVD7 372 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 ADAM22Q9P0K1 906 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 ANAPC7Q9UJX3 599 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 APC2O95996 2303 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 ACACAQ13085 2346 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 KANSL1LA0AUZ9 987 aa6.8□□□□□ -1.32
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CCL20-202ENST00000409189 M0QYV0 167 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 O00370 1275 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CYR61O00622 381 aa6.8□□□□□ -1.32
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CCL20-202ENST00000409189 EPHA5P54756 1037 aa6.8□□□□□ -1.32
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CCL20-202ENST00000409189 Q8TCH9 128 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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CCL20-202ENST00000409189 PARD6BQ9BYG5 372 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SDCBP2Q9H190 292 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 GDAP2Q9NXN4 497 aa6.8□□□□□ -1.32
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