RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369301.3

NHLRC2-201, Transcript of NHL repeat containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene NHLRC2, Length 11,051 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2-201ENST00000369301 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa8.66□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 EPORP19235 508 aa8.66□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 RPS9P46781 194 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 IL18Q14116 193 aa8.66□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 DGCR6Q14129 220 aa8.66□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 FAM153CQ494X1 144 aa8.66□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 DNAJC10Q8IXB1 793 aa8.66□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 FAM83DQ9H4H8 585 aa8.66□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 C19orf12Q9NSK7 152 aa8.66□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.66□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 PDXKO00764 312 aa8.66□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 CLEC3AO75596 197 aa8.66□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 MATN4O95460 622 aa8.66□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 RCAN1P53805 252 aa8.66□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 ZNF550Q7Z398 422 aa8.66□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 P4HA3Q7Z4N8 544 aa8.66□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 DCLRE1BQ9H816 532 aa8.66□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 METP08581 1390 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 VIL1P09327 827 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 OR3A3P47888 321 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 OR3A2P47893 321 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 SCRN1Q12765 414 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 BCL2A1Q16548 175 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 TTC7BQ86TV6 843 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 LZTR1Q8N653 840 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 C15orf40Q8WUR7 153 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 RETREG1Q9H6L5 497 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 H3BM21 787 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 MAGEA4P43358 317 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 CREB5Q02930 508 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 MILR1Q7Z6M3 343 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 ZNF565Q8N9K5 539 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 CD101Q93033 1021 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 MPP4Q96JB8 637 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 C2orf72A6NCS6 295 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 AHCYL1O43865 530 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 OR10H3O60404 316 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 IFNA10P01566 189 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 SEC23AQ15436 765 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 PDSS1Q5T2R2 415 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 PIK3R6Q5UE93 754 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 C1orf186Q6ZWK4 172 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 RFKQ969G6 155 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 C3orf18Q9UK00 162 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 TNFRSF10BO14763 440 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 RIN1Q13671 783 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 AP5B1Q2VPB7 878 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 KATNAL2Q8IYT4 538 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 PNPLA2Q96AD5 504 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 ETS1P14921 441 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 PGAM2P15259 253 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 ZNF20P17024 532 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 PPIBP23284 216 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 TAF5Q15542 800 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 TTC27Q6P3X3 843 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 TIGD4Q8IY51 512 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 UBR7Q8N806 425 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 LENG9Q96B70 501 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 PI4K2AQ9BTU6 479 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 SLC25A23Q9BV35 468 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 RRN3Q9NYV6 651 aa8.65□□□□□ -1.02
NHLRC2-201ENST00000369301 IFNAR1P17181 557 aa8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 UNC5CLQ8IV45 518 aa8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 ZNF276Q8N554 614 aa8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 NT5MQ9NPB1 228 aa8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 ATXN10Q9UBB4 475 aa8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 ESYT3A0FGR9 886 aa8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 CAPN14A8MX76 684 aa8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 SLC34A2O95436 690 aa8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 ALPPL2P10696 532 aa8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 EPCAMP16422 314 aa8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 RUNX2Q13950 521 aa8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 UBXN10Q96LJ8 280 aa8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 ADAMTS3O15072 1205 aa8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 RFX4Q33E94 735 aa8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 AGKQ53H12 422 aa8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 STK32CQ86UX6 486 aa8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 LIX1Q8N485 282 aa8.65□□□□□ -1.03
NHLRC2-201ENST00000369301 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms