RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 TNKS2Q9H2K2 1166 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 ADPRHL2Q9NX46 363 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 VAV1P15498 845 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 ACADSP16219 412 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 SOX6P35712 828 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 TTMPQ5BVD1 217 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 CERCAMQ5T4B2 595 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 FAM45BPQ6NSW5 357 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 FAM45AQ8TCE6 357 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 PYDC1Q8WXC3 89 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 CAPNS2Q96L46 248 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 ATP6AP2O75787 350 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 NTSP30990 170 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 GLUD2P49448 558 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 PAGE2BQ5JRK9 111 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 STAG3L4Q8TBR4 150 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 BAP1Q92560 729 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 MECRQ9BV79 373 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 EXO5Q9H790 373 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 SLC28A3Q9HAS3 691 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 KANSL1LA0AUZ9 987 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 ELFN1P0C7U0 828 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 SERPINB1P30740 379 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 NEK3P51956 506 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 ANKRD23Q86SG2 305 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 UXS1Q8NBZ7 420 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 DNAJB14Q8TBM8 379 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 MAGEC3Q8TD91 643 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 SHC3Q92529 594 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 PROX1Q92786 737 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 PCDHB18PQ96TA0 734 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 LPIN3Q9BQK8 851 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 OSBPL6Q9BZF3 934 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 ATP6V1G2O95670 118 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 HOXC6P09630 235 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 PSMD8P48556 350 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 FAM110CQ1W6H9 321 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 GPAT3Q53EU6 434 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 KCNH1O95259 989 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 BMP10O95393 424 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 SELPP16109 830 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 TRIM32Q13049 653 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 NRF1Q16656 503 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 CRY2Q49AN0 593 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 LINGO1Q96FE5 620 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 STBD1O95210 358 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 CYP4F2P78329 520 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 CDK16Q00536 496 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 CREMQ03060 361 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 TRAF7Q6Q0C0 670 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 RASAL3Q86YV0 1011 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 TOP6BLQ8N6T0 577 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 CPXM1Q96SM3 734 aa13□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 OR10H2O60403 315 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 PRKCIP41743 596 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 PRKCZQ05513 592 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 TUSC3Q13454 348 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 RHBDF2Q6PJF5 856 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 KREMEN1Q96MU8 473 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 PHACTR1Q9C0D0 580 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 ASF1AQ9Y294 204 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 SEPT4O43236 478 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 PSEN1P49768 467 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 SLC25A3Q00325 362 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 PDZD7Q9H5P4 517 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 TSC22D2O75157 780 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 PTPN20Q4JDL3 420 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 FBXO48Q5FWF7 155 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 GCNT7Q6ZNI0 430 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 CEP68Q76N32 757 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 CMC1Q7Z7K0 106 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 HEATR4Q86WZ0 1026 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 B3GALT6Q96L58 329 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 MBOAT7Q96N66 472 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 HTATIP2Q9BUP3 242 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 RHBDL2Q9NX52 303 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 GULP1Q9UBP9 304 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-207ENST00000368226 PRKAB1Q9Y478 270 aa12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms