RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 INAQ16352 499 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 KCTD4Q8WVF5 259 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN32Q9NX65 697 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 TK2O00142 265 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 ADH1AP07327 375 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 LCLAT1Q6UWP7 414 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF446Q9NWS9 450 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 CLUHO75153 1309 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 TBL1XO60907 577 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PFKPQ01813 784 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PTPN20Q4JDL3 420 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 JOSD2Q8TAC2 188 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 VMP1Q96GC9 406 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 CLDN5O00501 218 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 CCNE2O96020 404 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MAPK9P45984 424 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MOB2Q70IA6 237 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 EPHX4Q8IUS5 362 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 CXorf40AQ8TE69 158 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 P2RY11Q96G91 374 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 RGSL1A5PLK6 1076 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PPM1AP35813 382 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 HK2P52789 917 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PSMD5Q16401 504 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MAPKAPK3Q16644 382 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 CYP20A1Q6UW02 462 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 GPR20Q99678 358 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MYL12AP19105 171 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 WNT3AP56704 352 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF276Q8N554 614 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 AADATQ8N5Z0 425 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PYDC1Q8WXC3 89 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 NDNQ99608 321 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 CORO1BQ9BR76 489 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PTGES3LE9PB15 166 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 ZW10O43264 779 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 NTSP30990 170 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 LBX2Q6XYB7 198 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 OR8H2Q8N162 312 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 C19orf18Q8NEA5 215 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MED26O95402 600 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 FYNP06241 537 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 ADRA1BP35368 520 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 GSSP48637 474 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 CCL23P55773 120 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 NOGQ13253 232 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 NEDD8Q15843 81 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 CES5AQ6NT32 575 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 TEKT5Q96M29 485 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MBOAT7Q96N66 472 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 XPR1Q9UBH6 696 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PRKG2Q13237 762 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM199Q8N511 208 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 OMDQ99983 421 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 NTRK1P04629 796 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 COX4I1P13073 169 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MAXP61244 160 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 TSNQ15631 228 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 LIPMQ5VYY2 423 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MAF1Q9H063 256 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 C4BPBP20851 252 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SLC25A3Q00325 362 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SMARCB1Q12824 385 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 TRABD2AQ86V40 505 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-203ENST00000366687 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms