RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365563.1

RNU6-54P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 54, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-54P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-54P-201ENST00000365563 TCF3P15923 654 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 ACVR2AP27037 513 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 CHATP28329 748 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 MAP2K2P36507 400 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 DCTP40126 519 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 PBX1P40424 430 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 CLCNKBP51801 687 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 MAP2K6P52564 334 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 CYP4A11Q02928 519 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 CTBP1Q13363 440 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 SLC29A2Q14542 456 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 KIR2DS1Q14954 304 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 WDR38Q5JTN6 314 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 ASPHD2Q6ICH7 369 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 WDR93Q6P2C0 686 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 TMEM88Q6PEY1 159 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 KRBA2Q6ZNG9 492 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 C16orf86Q6ZW13 317 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 SATL1Q86VE3 508 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF547Q8IVP9 402 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 YAF2Q8IY57 180 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 PRR22Q8IZ63 422 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 MIER2Q8N344 545 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 SUN3Q8TAQ9 357 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 TRIB2Q92519 343 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 SERAC1Q96JX3 654 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 MAP3K14Q99558 947 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 TRIM54Q9BYV2 358 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 VTA1Q9NP79 307 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 TNFRSF19Q9NS68 423 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 ADPRHL2Q9NX46 363 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 ASIC3Q9UHC3 531 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF180Q9UJW8 692 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 KCNS2Q9ULS6 477 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 LMTK3Q96Q04 1460 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 ARHGAP10A1A4S6 786 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 CPED1A4D0V7 1026 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 TMEM247A6NEH6 219 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 UNCXA6NJT0 531 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 K7ESF4 209 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 CHL1O00533 1208 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 NPC1O15118 1278 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 MID1O15344 667 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 HDAC3O15379 428 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 IL18RAPO95256 599 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 MOCS3O95396 460 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 MMP2P08253 660 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 GYS1P13807 737 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 UGT1A4P22310 534 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 SOX5P35711 763 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 RBMXP38159 391 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 TMPOP42166 694 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 MTHFRP42898 656 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 GSTM5P46439 218 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 SNX16P57768 344 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 NDPQ00604 133 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 NEDD9Q14511 834 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 AMZ1Q400G9 498 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 FAM90A2PQ658T7 463 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 TRNP1Q6NT89 227 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 TLDC1Q6P9B6 456 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 PGM2L1Q6PCE3 622 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 TIFABQ6ZNK6 161 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 SH2D5Q6ZV89 423 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 KRT27Q7Z3Y8 459 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 SERPINA11Q86U17 422 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 DENND1CQ8IV53 801 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 CCDC105Q8IYK2 499 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 ABCA7Q8IZY2 2146 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 RBFAQ8N0V3 343 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 RNF152Q8N8N0 203 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 C17orf47Q8NEP4 570 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 BBS10Q8TAM1 723 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-54P-201ENST00000365563 MAGEC3Q8TD91 643 aa0.12□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms