RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363054.1

RNU6-1252P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1252, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1252P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1252P-201ENST00000363054 ANKRD1Q15327 319 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 IL20RBQ6UXL0 311 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 SYT13Q7L8C5 426 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 TRIM74Q86UV6 250 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 TRIM73Q86UV7 250 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 AADATQ8N5Z0 425 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 SPPL3Q8TCT6 385 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 TRIB2Q92519 343 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 MASTLQ96GX5 879 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 IL25Q9H293 177 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 MVB12BQ9H7P6 319 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 PLEKHA2Q9HB19 425 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 RCE1Q9Y256 329 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 GDAQ9Y2T3 454 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 NOTCH4Q99466 2003 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 A0A0A0MQY5 61 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 DYTNA2CJ06 578 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 IRAK2O43187 625 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 TSPAN3O60637 253 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 NDUFB4O95168 129 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 VNN2O95498 520 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 CYP21A2P08686 494 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 PTPN2P17706 415 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 CHATP28329 748 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 SERPINB3P29508 390 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 ADD2P35612 726 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 LIFRP42702 1097 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 CLCN5P51795 746 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 RAD23BP54727 409 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 DLX5P56178 289 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 PDCLQ13371 301 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 MYBPC2Q14324 1141 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 SYCP2LQ5T4T6 812 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 RRAGAQ7L523 313 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 KCNH5Q8NCM2 988 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 SETD9Q8NE22 299 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 FEM1CQ96JP0 617 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 LHPPQ9H008 270 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 ACAD9Q9H845 621 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 ARHGAP10A1A4S6 786 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 BMPR1BO00238 502 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 ANP32CO43423 234 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 KRT38O76015 456 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 CSF1P09603 554 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 LYL1P12980 280 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 ARSFP54793 590 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 SLC18A2Q05940 514 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 DLG1Q12959 904 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 TRAF3Q13114 568 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 AP5B1Q2VPB7 878 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 XKR9Q5GH70 373 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 ANKRD45Q5TZF3 282 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 NAA35Q5VZE5 725 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 USP43Q70EL4 1123 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 SPICE1Q8N0Z3 855 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 DNAAF1Q8NEP3 725 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 POF1BQ8WVV4 589 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 HSPH1Q92598 858 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 IL17FQ96PD4 163 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 CD180Q99467 661 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 EPYCQ99645 322 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 MSTO1Q9BUK6 570 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 OCIAD1Q9NX40 245 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 OR6C3Q9NZP0 311 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 C17orf100A8MU93 164 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 ADAP00813 363 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 MCM3P25205 808 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 HNF1BP35680 557 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 GPD2P43304 727 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 BNC1Q01954 994 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 ACSM2AQ08AH3 577 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 MYBPHQ13203 477 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1252P-201ENST00000363054 ME3Q16798 604 aa2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms