RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340006.6

CSRP1-201, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSRP1, Length 1,952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1-201ENST00000340006 STON1Q9Y6Q2 735 aa14.95□□□□□ -0.02
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CSRP1-201ENST00000340006 RNF40O75150 1001 aa14.94□□□□□ -0.02
CSRP1-201ENST00000340006 PMPCBO75439 489 aa14.94□□□□□ -0.02
CSRP1-201ENST00000340006 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CSRP1-201ENST00000340006 POP4O95707 220 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CSRP1-201ENST00000340006 APRTP07741 180 aa14.94□□□□□ -0.02
CSRP1-201ENST00000340006 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CSRP1-201ENST00000340006 STARD6P59095 220 aa14.94□□□□□ -0.02
CSRP1-201ENST00000340006 NIPAL4Q0D2K0 466 aa14.94□□□□□ -0.02
CSRP1-201ENST00000340006 CALCOCO2Q13137 446 aa14.94□□□□□ -0.02
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CSRP1-201ENST00000340006 PCGF5Q86SE9 256 aa14.94□□□□□ -0.02
CSRP1-201ENST00000340006 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
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CSRP1-201ENST00000340006 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CSRP1-201ENST00000340006 PTPRN2Q92932 1015 aa14.94□□□□□ -0.02
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CSRP1-201ENST00000340006 NUDCD1Q96RS6 583 aa14.94□□□□□ -0.02
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CSRP1-201ENST00000340006 TMEM245Q9H330 911 aa14.94□□□□□ -0.02
CSRP1-201ENST00000340006 HCN2Q9UL51 889 aa14.94□□□□□ -0.02
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CSRP1-201ENST00000340006 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CSRP1-201ENST00000340006 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa14.94□□□□□ -0.02
CSRP1-201ENST00000340006 SHISA7A6NL88 538 aa14.94□□□□□ -0.02
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CSRP1-201ENST00000340006 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
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CSRP1-201ENST00000340006 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CSRP1-201ENST00000340006 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
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CSRP1-201ENST00000340006 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa14.94□□□□□ -0.02
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CSRP1-201ENST00000340006 FSD1LQ9BXM9 530 aa14.93□□□□□ -0.02
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CSRP1-201ENST00000340006 ARSIQ5FYB1 569 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRP1-201ENST00000340006 RALGPS1Q5JS13 557 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRP1-201ENST00000340006 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CSRP1-201ENST00000340006 C9orf64Q5T6V5 341 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRP1-201ENST00000340006 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRP1-201ENST00000340006 STK40Q8N2I9 435 aa14.92□□□□□ -0.02
CSRP1-201ENST00000340006 CHST14Q8NCH0 376 aa14.92□□□□□ -0.02
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