RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 RPL21P46778 160 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 NEK3P51956 506 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 IRF8Q02556 426 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 FBXO48Q5FWF7 155 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 PAGE2BQ5JRK9 111 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 OSCP1Q8WVF1 389 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 SOCS4Q8WXH5 440 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 TLE6Q9H808 572 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 ABCC13Q9NSE7 274 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 UBAP1Q9NZ09 502 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 A0A087X0B3 334 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 BTN3A3O00478 584 aa10.65□□□□□ -0.7
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CLN8-201ENST00000331222 FDPSP14324 419 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 PGAM1P18669 254 aa10.65□□□□□ -0.7
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CLN8-201ENST00000331222 MCOLN2Q8IZK6 566 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 OR14C36Q8NHC7 312 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 PHF11Q9UIL8 331 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 MRASO14807 208 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 CLOCKO15516 846 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 RABGGTBP53611 331 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 HECTD3Q5T447 861 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 XRRA1Q6P2D8 792 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 TRPV3Q8NET8 790 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 OR2L5Q8NG80 312 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 PLA2G12BQ9BX93 195 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 CXorf56Q9H5V9 222 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 EPS8L2Q9H6S3 715 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 TMBIM4Q9HC24 238 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 PSMD13Q9UNM6 376 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 SMAPO00193 183 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 INMTO95050 263 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 VIL1P09327 827 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 MAGP20916 626 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 GABRR2P28476 465 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 GRIA3P42263 894 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 PPP2R2BQ00005 443 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 DUSP4Q13115 394 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 PRKG2Q13237 762 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 ARMC3Q5W041 872 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 PACS2Q86VP3 889 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 ZNF280BQ86YH2 543 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 MYLPFQ96A32 169 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 PTPN18Q99952 460 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 MCMBPQ9BTE3 642 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 PPCSQ9HAB8 311 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 FAM205AQ6ZU69 1335 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 MYH8P13535 1937 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 PTPRJQ12913 1337 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 ANKRD63C9JTQ0 380 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 ELFN1P0C7U0 828 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 HTR1BP28222 390 aa10.65□□□□□ -0.7
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CLN8-201ENST00000331222 FOXM1Q08050 763 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 PUDPQ08623 228 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 MINDY4Q4G0A6 757 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 PJA1Q8NG27 643 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 COMMD9Q9P000 198 aa10.65□□□□□ -0.7
CLN8-201ENST00000331222 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa10.65□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 F8VP50 259 aa10.65□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 DGKAP23743 735 aa10.65□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 TNFSF9P41273 254 aa10.65□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 MASP1P48740 699 aa10.65□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 GALK1P51570 392 aa10.65□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 ARMCX6Q7L4S7 300 aa10.65□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 TMPRSS11BQ86T26 416 aa10.65□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 ARNTL2Q8WYA1 636 aa10.65□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa10.65□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 POPDC2Q9HBU9 364 aa10.65□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 IKZF3Q9UKT9 509 aa10.65□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.711e-10■■■■■ 241.2
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CLN8-201ENST00000331222 OR10H3O60404 316 aa10.64□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 PROSCO94903 275 aa10.64□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 CCNA2P20248 432 aa10.64□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 AMZ1Q400G9 498 aa10.64□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 Q4G0T1 1027 aa10.64□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 FAM9CQ8IZT9 166 aa10.64□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 ABRAQ8N0Z2 381 aa10.64□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 DNERQ8NFT8 737 aa10.64□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 UGT2B28Q9BY64 529 aa10.64□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 MRGBPQ9NV56 204 aa10.64□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 PSME2Q9UL46 239 aa10.64□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa10.64□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 MADDQ8WXG6 1647 aa10.64□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 A0A087X1B8 175 aa10.64□□□□□ -0.71
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