RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEL1L3Q68CR1 1132 aa19.83■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXL19Q6PCT2 694 aa19.83■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMCO3Q6UWJ1 677 aa19.83■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 LZTR1Q8N653 840 aa19.83■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa19.83■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL32Q96NJ5 620 aa19.83■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 SP110Q9HB58 689 aa19.83■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCMT1Q9UIC8 334 aa19.83■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 H0Y8X5 98 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 AP1G1O43747 822 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDH8O95206 1070 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRLRP16471 622 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL4RP24394 825 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGRP47804 291 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL10RBQ08334 325 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF423Q2M1K9 1284 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 GDPD4Q6W3E5 623 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC35G2Q8TBE7 412 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLK6Q92876 244 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC32A1Q9H598 525 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 TM7SF3Q9NS93 570 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL11Q9NVR0 708 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 CA5BQ9Y2D0 317 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHROOM3Q8TF72 1996 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNK3O14649 394 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH3BP5O60239 455 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTA2O94776 668 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIGNO95427 931 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAD51Q06609 339 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMRN1Q13201 1228 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPYSL3Q14195 570 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAXDQ8IW45 347 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM145Q8NBT3 493 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFFLQ8WZ73 363 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB7BQ96AH8 199 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAMK1GQ96NX5 476 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYOCQ99972 504 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 GGT7Q9UJ14 662 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITM2BQ9Y287 266 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa19.8■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC31A1O15431 190 aa19.8■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 PALMO75781 387 aa19.8■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 NXPH1P58417 271 aa19.8■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 MESDQ14696 234 aa19.8■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC45A4Q5BKX6 768 aa19.8■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC73Q5JTD7 316 aa19.8■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa19.8■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHOT2Q8IXI1 618 aa19.8■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 MFSD2AQ8NA29 543 aa19.8■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 SKA1Q96BD8 255 aa19.8■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 FZD3Q9NPG1 666 aa19.8■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 DKK3Q9UBP4 350 aa19.8■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa19.8■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPAN11A1L157 253 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 TLR4O00206 839 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 AREL1O15033 823 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 MUSKO15146 869 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 MFSD11O43934 449 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 PEX11BO96011 259 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT7P08729 469 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINB6P35237 376 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSNK1DP48730 415 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCT8P50990 548 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS21P63220 83 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM193AP78312 1265 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGL2Q14314 439 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMCO4Q5TGY1 634 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 IQCHQ86VS3 1027 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF599Q96NL3 588 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF670Q9BS34 389 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 CALN1Q9BXU9 219 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 GDF3Q9NR23 364 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 INTUQ9ULD6 942 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GTQ1 180 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPAN6O43657 245 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAFKO60675 156 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCA5LO95447 670 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 PMLP29590 882 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL9RQ01113 521 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC10A7Q0GE19 358 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 LBRQ14739 615 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 STAT4Q14765 748 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDK2Q15119 407 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCEAL1Q15170 157 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHBQ15464 509 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms