RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 PRKAA2P54646 552 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 SNX30Q5VWJ9 437 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 NADSYN1Q6IA69 706 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 KIAA0408Q6ZU52 694 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 MAVSQ7Z434 540 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 TMPRSS6Q8IU80 811 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 ARHGAP24Q8N264 748 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 LRRC43Q8N309 656 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 FBXO22Q8NEZ5 403 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 CALML6Q8TD86 181 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 SCYL1Q96KG9 808 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 TTLL2Q9BWV7 592 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 FBXO5Q9UKT4 447 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF195O14628 629 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 FKTNO75072 461 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 KLHL2O95198 593 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 MYL4P12829 197 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 ATF6P18850 670 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 CPA2P48052 419 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 ARHGAP8P85298 464 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 RABGAP1LQ5R372 815 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 TSTD2Q5T7W7 516 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM151AQ8N4L1 468 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 KCTD4Q8WVF5 259 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 ELMO2Q96JJ3 720 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa21.97■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 F5H5T6 163 aa21.96■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 TK2O00142 265 aa21.96■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 PEX11AO75192 247 aa21.96■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 ANP32DO95626 131 aa21.96■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 GM2AP17900 193 aa21.96■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 AOC1P19801 751 aa21.96■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 LBRQ14739 615 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 LIPMQ5VYY2 423 aa21.96■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 MFSD6LQ8IWD5 586 aa21.96■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 ARRDC2Q8TBH0 407 aa21.96■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 TADA1Q96BN2 335 aa21.96■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 CDH19Q9H159 772 aa21.96■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 ETFBP38117 255 aa21.95■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 PGGT1BP53609 377 aa21.95■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 KDSRQ06136 332 aa21.95■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 CEP97Q8IW35 865 aa21.95■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 PGBD5Q8N414 524 aa21.95■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF781Q8N8C0 355 aa21.95■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 GPATCH11Q8N954 259 aa21.95■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 SCLYQ96I15 445 aa21.95■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 CEP295NLQ96MC4 621 aa21.95■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 NUDCD1Q96RS6 583 aa21.95■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 DNMT3LQ9UJW3 386 aa21.95■■□□□ 1.11
SPHK1-201ENST00000323374 SBK3P0C264 359 aa21.95■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 ACVRL1P37023 503 aa21.95■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 GLRBP48167 497 aa21.95■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 KCNQ1P51787 676 aa21.95■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 POU4F1Q01851 419 aa21.95■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 CFAP157Q5JU67 520 aa21.95■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 SLC8B1Q6J4K2 584 aa21.95■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa21.95■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 RFWD3Q6PCD5 774 aa21.95■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 LGI2Q8N0V4 545 aa21.95■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 STYXQ8WUJ0 223 aa21.95■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 MYEOVQ96EZ4 313 aa21.95■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 MYLKQ15746 1914 aa21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 PRAMEF11O60813 436 aa21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 TUFMP49411 452 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 SLC12A2P55011 1212 aa21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 IHHQ14623 411 aa21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 TMCO4Q5TGY1 634 aa21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 MTRRQ9UBK8 725 aa21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 GREB1Q4ZG55 1949 aa21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 A0A087X1B8 175 aa21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 ADAM12O43184 909 aa21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 DIAPH2O60879 1101 aa21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 ENTPD5O75356 428 aa21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 LMNAP02545 664 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 PGM1P36871 562 aa21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 TAS2R39P59534 338 aa21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 USP4Q13107 963 aa21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF460Q14592 562 aa21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 USP41Q3LFD5 358 aa21.94■■□□□ 1.1
SPHK1-201ENST00000323374 C5orf22Q49AR2 442 aa21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms