RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318266.9

PTPRA-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRA, Length 3,219 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-202ENST00000318266 CLCN3P51790 818 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 EFNA5P52803 228 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 IGBP1P78318 339 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 GHRHRQ02643 423 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 CTBP1Q13363 440 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 SURF1Q15526 300 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 DPYSL2Q16555 572 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 C6orf10Q5SRN2 563 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 CNSTQ6PJW8 725 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 PIGZQ86VD9 579 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 EPHX4Q8IUS5 362 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 KDM1BQ8NB78 822 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 LPAR1Q92633 364 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 NT5C1AQ9BXI3 368 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 DGKBQ9Y6T7 804 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 B4GALT4O60513 344 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 NOL3O60936 208 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 DDHD2O94830 711 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 NMBRP28336 390 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 NR2C2P49116 596 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 MERTKQ12866 999 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 DENND6AQ8IWF6 608 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 CXorf38Q8TB03 319 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 CDHR1Q96JP9 859 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 TCF12Q99081 682 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 NRBP2Q9NSY0 501 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 SACM1LQ9NTJ5 587 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 NFKBIEO00221 500 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 DLGAP1O14490 977 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 EI24O14681 340 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 UBDO15205 165 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 CAPN15O75808 1086 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 IQCF3P0C7M6 154 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 STAG3L1P0CL83 205 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 YBX1P67809 324 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 RGS21Q2M5E4 152 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 TRIM16LQ309B1 348 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 CLEC6AQ6EIG7 209 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 LCLAT1Q6UWP7 414 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 FAM35AQ86V20 835 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 PHF21BQ96EK2 531 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 NAT9Q9BTE0 207 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 POMKQ9H5K3 350 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 SAGE1Q9NXZ1 904 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 GIMAP2Q9UG22 337 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 LRRC37AA6NMS7 1700 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 CFAP99D6REC4 459 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 SRP72O76094 671 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 SLC35E2BP0CK96 405 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 CHRM3P20309 590 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 OXTRP30559 389 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 MAGEA12P43365 314 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 GJA9P57773 515 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 MPP1Q00013 466 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 STX5Q13190 355 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 GRM1Q13255 1194 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 NAB1Q13506 487 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 BFSP2Q13515 415 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 LRP8Q14114 963 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 C6orf183Q5T699 404 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 PPP4R4Q6NUP7 873 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 UTS2BQ765I0 119 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 KDELC2Q7Z4H8 507 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 SHCBP1Q8NEM2 672 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 FTHL17Q9BXU8 183 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 CHST12Q9NRB3 414 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 CROTQ9UKG9 612 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 ST14Q9Y5Y6 855 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 ARID2Q68CP9 1835 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 ANKRD12Q6UB98 2062 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 TRIM24O15164 1050 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 TIMM44O43615 452 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 CABYRO75952 493 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 ZNF12P17014 697 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 ZNF24P17028 368 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 MATN1P21941 496 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 MLLT10P55197 1068 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 TNK2Q07912 1038 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRA-202ENST00000318266 CBLBQ13191 982 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms