RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000310027.9

C1orf61-201, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene C1orf61, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-201ENST00000310027 TSC1Q92574 1164 aa8.56□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 TRIM11Q96F44 468 aa8.56□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 IFT43Q96FT9 208 aa8.56□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 HMCESQ96FZ2 354 aa8.56□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 KLHL32Q96NJ5 620 aa8.56□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 SYT11Q9BT88 431 aa8.56□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.56□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 TTYH3Q9C0H2 523 aa8.56□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 HAUS4Q9H6D7 363 aa8.56□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 TAS2R14Q9NYV8 317 aa8.56□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.56□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 SCINQ9Y6U3 715 aa8.56□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 FAM149AA5PLN7 773 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 TMEM191CA6NGB0 347 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 IGLON5A6NGN9 336 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 ARHGAP42A6NI28 874 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 H3BM21 787 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 TAF4O00268 1085 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 DAPK3O43293 454 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 SIGLEC6O43699 453 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 PRPSAP2O60256 369 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 PIAS2O75928 621 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 FTLP02792 175 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 CAPNS1P04632 268 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 XPAP23025 273 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 DGKAP23743 735 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 ABL2P42684 1182 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 SUOXP51687 545 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 DAB2P98082 770 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 E2F1Q01094 437 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 OGDHQ02218 1023 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 FGL2Q14314 439 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 NR1I3Q14994 352 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 IQCB1Q15051 598 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 FIGNQ5HY92 759 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 DNAAF5Q86Y56 855 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 SLC25A45Q8N413 288 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 DENND6BQ8NEG7 585 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 OR4C6Q8NH72 309 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 MDM1Q8TC05 714 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 CXorf40AQ8TE69 158 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 ZNF653Q96CK0 615 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 BMFQ96LC9 184 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 KLC2Q9H0B6 622 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 DNAJC28Q9NX36 388 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 DKK3Q9UBP4 350 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 DKK4Q9UBT3 224 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 AKAP13Q12802 2813 aa8.55□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 POM121BA6NF01 834 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 TRIM38O00635 465 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 TOR1BO14657 336 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 AREL1O15033 823 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 RAD51BO15315 384 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 FFAR2O15552 330 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 TM7SF2O76062 418 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 CSF2P04141 144 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 MYBL1P10243 752 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 ACP1P24666 158 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 MIPP30301 263 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 THOP1P52888 689 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 CYP4F3Q08477 520 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 ELP6Q0PNE2 266 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 CAMK2BQ13554 666 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 PTK2BQ14289 1009 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 CYTH1Q15438 398 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 PROX2Q3B8N5 592 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 CFAP58Q5T655 872 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 HES3Q5TGS1 186 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 VPS36Q86VN1 386 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 PARGQ86W56 976 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 MARCH9Q86YJ5 346 aa8.54□□□□□ -1.04
C1orf61-201ENST00000310027 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms