RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 TRIML2Q8N7C3 387 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 SLC7A14Q8TBB6 771 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 FERMT1Q9BQL6 677 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 Q9H521 79 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 TRPV2Q9Y5S1 764 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 CDH3P22223 829 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 CCDC153Q494R4 210 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 MAVSQ7Z434 540 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 OR52K1Q8NGK4 314 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 LPPQ93052 612 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 CERS2Q96G23 380 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 SMOQ99835 787 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 ACSS2Q9NR19 701 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 POLBP06746 335 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 CTSHP09668 335 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 CLCNKBP51801 687 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 DAOAP59103 153 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 CTBSQ01459 385 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 SEMA3BQ13214 749 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 USP41Q3LFD5 358 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 PID1Q7Z2X4 250 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 PQLC1Q8N2U9 271 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 ATP2A3Q93084 1043 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 SORT1Q99523 831 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 FBXO21O94952 628 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 IGHA2P01877 340 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 AKR1A1P14550 325 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 AOC1P19801 751 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 ADRA1BP35368 520 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 GP5P40197 560 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 INSCQ1MX18 579 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 C17orf99Q6UX52 265 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 XKR5Q6UX68 686 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 KBTBD6Q86V97 674 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 TSPAN14Q8NG11 270 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 MOCOSQ96EN8 888 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 PCED1BQ96HM7 432 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 PLEKHA8Q96JA3 519 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 SERPINE1P05121 402 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 THP07101 528 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 ERCC2P18074 760 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 PTPN3P26045 913 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 TYK2P29597 1187 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 PGGT1BP53609 377 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 SPANXN3Q5MJ09 141 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 PGM2L1Q6PCE3 622 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 AGR3Q8TD06 166 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 KCNK16Q96T55 309 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 SLC9A7Q96T83 725 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 APOL2Q9BQE5 337 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 MIOSQ9NXC5 875 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 A0A1W2PQ67 120 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 CCDC78A2IDD5 438 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 MAGEA12P43365 314 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 LHX1P48742 406 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 SOCS4Q8WXH5 440 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 ISL2Q96A47 359 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 CPNE1Q99829 537 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 RRAGCQ9HB90 399 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 TXNDC16Q9P2K2 825 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 VPS51Q9UID3 782 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 RAB26Q9ULW5 256 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 NUP205Q92621 2012 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 ZMPSTE24O75844 475 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 NEK2P51955 445 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 SCAPQ12770 1279 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 DLG2Q15700 870 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 CYP2A13Q16696 494 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 TRPV1Q8NER1 839 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 NTAN1Q96AB6 310 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 AGAP2Q99490 1192 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 CAB39LQ9H9S4 337 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 COPG2Q9UBF2 871 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 J3QRK9 145 aa20.37■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
HPS6-201ENST00000299238 AP2A1O95782 977 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms