RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 TEX26Q8N6G2 289 aa24.22■■□□□ 1.47
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TRIM54-201ENST00000296098 COG4Q9H9E3 785 aa24.22■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 HCSTQ9UBK5 93 aa24.22■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 FBXO5Q9UKT4 447 aa24.22■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 LRFN2Q9ULH4 789 aa24.22■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 DRGXA6NNA5 263 aa24.22■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 RAMP2O60895 175 aa24.22■■□□□ 1.47
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TRIM54-201ENST00000296098 KIAA0408Q6ZU52 694 aa24.22■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 GPATCH11Q8N954 259 aa24.22■■□□□ 1.47
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TRIM54-201ENST00000296098 GIMAP7Q8NHV1 300 aa24.22■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 WDR60Q8WVS4 1066 aa24.22■■□□□ 1.47
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TRIM54-201ENST00000296098 PARP15Q460N3 678 aa24.21■■□□□ 1.47
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TRIM54-201ENST00000296098 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
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TRIM54-201ENST00000296098 DRC3Q9H069 523 aa24.21■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 XPR1Q9UBH6 696 aa24.21■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 PHF24Q9UPV7 400 aa24.21■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 TM7SF2O76062 418 aa24.2■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 GRIA4P48058 902 aa24.2■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 IL10RBQ08334 325 aa24.2■■□□□ 1.47
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TRIM54-201ENST00000296098 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
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TRIM54-201ENST00000296098 RTP2Q5QGT7 225 aa24.2■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 SCUBE1Q8IWY4 988 aa24.2■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
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TRIM54-201ENST00000296098 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 A0A087X1B8 175 aa24.2■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 MEI4A8MW99 385 aa24.2■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 H7C4K7 107 aa24.2■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 POU4F1Q01851 419 aa24.2■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 GPNMBQ14956 572 aa24.2■■□□□ 1.46
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TRIM54-201ENST00000296098 RAP2CQ9Y3L5 183 aa24.2■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 TARM1B6A8C7 271 aa24.19■■□□□ 1.46
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TRIM54-201ENST00000296098 CHRNGP07510 517 aa24.19■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
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TRIM54-201ENST00000296098 MAPKAPK2P49137 400 aa24.19■■□□□ 1.46
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TRIM54-201ENST00000296098 SLC12A2P55011 1212 aa24.19■■□□□ 1.46
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TRIM54-201ENST00000296098 RCN1Q15293 331 aa24.19■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 ULK2Q8IYT8 1036 aa24.19■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 AGR3Q8TD06 166 aa24.19■■□□□ 1.46
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TRIM54-201ENST00000296098 CCSER2Q9H7U1 834 aa24.19■■□□□ 1.46
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TRIM54-201ENST00000296098 FSCBQ5H9T9 825 aa24.18■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 PGBD5Q8N414 524 aa24.18■■□□□ 1.46
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TRIM54-201ENST00000296098 TRPA1O75762 1119 aa24.18■■□□□ 1.46
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TRIM54-201ENST00000296098 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TRIM54-201ENST00000296098 DLG1Q12959 904 aa24.18■■□□□ 1.46
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