RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 CTBP1Q13363 440 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 SH2D4BQ5SQS7 431 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ARMC3Q5W041 872 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 FBXL19Q6PCT2 694 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 SAPCD2Q86UD0 394 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 MYLPFQ96A32 169 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 FICDQ9BVA6 458 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 NDUFA13Q9P0J0 144 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 MATN3O15232 486 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 IGLV3-25P01717 112 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 MYL3P08590 195 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 SLC10A3P09131 477 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ARNTP27540 789 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ADRA1AP35348 466 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 CEACAM7Q14002 265 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 TSTD2Q5T7W7 516 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 TMEM198Q66K66 360 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 MFSD6LQ8IWD5 586 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ADCY4Q8NFM4 1077 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 GCNAQ96QF7 691 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 HAPLN3Q96S86 360 aa28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 JUNP05412 331 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 HOXC13P31276 330 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 CD151P48509 253 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 POU4F1Q01851 419 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 BRMS1LQ5PSV4 323 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 CCNYL1Q8N7R7 359 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 CLIC5Q9NZA1 410 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 RIMS3Q9UJD0 308 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 PACSIN3Q9UKS6 424 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 MAFKO60675 156 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 HOXC8P31273 242 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 RPL9P32969 192 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 SLC1A2P43004 574 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 PGGT1BP53609 377 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 CNGA3Q16281 694 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 AP1ARQ63HQ0 302 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ARPINQ7Z6K5 226 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 C3orf58Q8NDZ4 430 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 CEP70Q8NHQ1 597 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 SOCS4Q8WXH5 440 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ELMO2Q96JJ3 720 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 FAR2Q96K12 515 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 GAD1Q99259 594 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 PRKD2Q9BZL6 878 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 EPB41L1Q9H4G0 881 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 TREX1Q9NSU2 369 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 FAM105AQ9NUU6 356 aa28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 MEIS3P2A8K0S8 358 aa28.29■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 INHBEP58166 350 aa28.29■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ZNF460Q14592 562 aa28.29■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 FTHL17Q9BXU8 183 aa28.29■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 AP5M1Q9H0R1 490 aa28.29■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 VCX3AQ9NNX9 186 aa28.29■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa28.29■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 TLR1Q15399 786 aa28.28■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 EP400NLQ6ZTU2 488 aa28.28■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 KIAA0408Q6ZU52 694 aa28.28■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 TICAM1Q8IUC6 712 aa28.28■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 CCDC126Q96EE4 140 aa28.28■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa28.28■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 MYLKQ15746 1914 aa28.28■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 TCAF2A6NFQ2 919 aa28.28■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 SDHDO14521 159 aa28.28■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 CFLARO15519 480 aa28.28■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 SLC12A2P55011 1212 aa28.28■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 PKNOX1P55347 436 aa28.28■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 TAF2Q6P1X5 1199 aa28.28■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 FSD1LQ9BXM9 530 aa28.28■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 SIK2Q9H0K1 926 aa28.28■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 POMKQ9H5K3 350 aa28.28■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa28.28■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 CAPNS1P04632 268 aa28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ODC1P11926 461 aa28.27■■■□□ 2.12
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