RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP20.65■□□□□ 0.9
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBC1D3BA6NDS4 549 aa20.64■□□□□ 0.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 J3KR12 359 aa20.64■□□□□ 0.9
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 LINGO4Q6UY18 593 aa20.64■□□□□ 0.89
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 TEX26Q8N6G2 289 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 APODP05090 189 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GRIA2P42262 883 aa20.63■□□□□ 0.89
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 OXCT1P55809 520 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CBX1P83916 185 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MARC1Q5VT66 337 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGDCC3Q8IVU1 814 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UBALD2Q8IYN6 164 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AHI1Q8N157 1196 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SIX5Q8N196 739 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM3CQ92520 227 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PGM2Q96G03 612 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SIGLEC10Q96LC7 697 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF599Q96NL3 588 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRC40Q9H9A6 602 aa20.63■□□□□ 0.89
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZMPSTE24O75844 475 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANXA9O76027 345 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MT-CO1P00395 513 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CPP00450 1065 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EGFP01133 1207 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GLULP15104 373 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SSTR1P30872 391 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ETFBP38117 255 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STK19P49842 368 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARF5P84085 180 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC12A1Q13621 1099 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EMC10Q5UCC4 262 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATG2BQ96BY7 2078 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TLDC2A0PJX2 215 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GSTA2P09210 222 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZXDAP98168 799 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.61■□□□□ 0.89
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 LONRF1Q17RB8 773 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM196Q5HYL7 178 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CAPN12Q6ZSI9 719 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa20.61■□□□□ 0.89
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ELOVL2Q9NXB9 296 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HCN2Q9UL51 889 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYLKQ15746 1914 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMIM23A6NLE4 172 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 K7EQS6 105 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AP3B1O00203 1094 aa20.61■□□□□ 0.89
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 KDELR3O43731 214 aa20.61■□□□□ 0.89
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