RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 ACOX1Q15067 660 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 KCNA10Q16322 511 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 SOWAHAQ2M3V2 549 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 DEPDC1Q5TB30 811 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 LPCAT4Q643R3 524 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ERAP2Q6P179 960 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 FAM151BQ6UXP7 276 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 NAPRTQ6XQN6 538 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 HPS6Q86YV9 775 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ZNF567Q8N184 647 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 MPP5Q8N3R9 675 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 MAB21L3Q8N8X9 362 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 OR4K2Q8NGD2 314 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 WDR48Q8TAF3 677 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 BTN2A2Q8WVV5 523 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 SLC44A1Q8WWI5 657 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 SELENOMQ8WWX9 145 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 CENPTQ96BT3 561 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 FAR2Q96K12 515 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 BBS2Q9BXC9 721 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 GRIP2Q9C0E4 1043 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 LHX5Q9H2C1 402 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 CYLDQ9NQC7 956 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 AAASQ9NRG9 546 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 COQ4Q9Y3A0 265 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 U3KQV3 271 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 KNTC1P50748 2209 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 CASZ1Q86V15 1759 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 MYO10Q9HD67 2058 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 TBC1D3BA6NDS4 549 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 CCDC154A6NI56 674 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 C2CD4BA6NLJ0 364 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 SCAMP1O15126 338 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 KRT6AP02538 564 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 KRT6BP04259 564 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 COX4I1P13073 169 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 TYMPP19971 482 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 KRT6CP48668 564 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 TRPC1P48995 793 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 PGGT1BP53609 377 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 SLC5A3P53794 718 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 CDK18Q07002 472 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 RALGDSQ12967 914 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ZBTB17Q13105 803 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 CRY1Q16526 586 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 KCTD21Q4G0X4 260 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 TIGD2Q4W5G0 525 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 LRRC73Q5JTD7 316 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ARHGAP17Q68EM7 881 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 CLEC6AQ6EIG7 209 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 FOXR2Q6PJQ5 311 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 HFE2Q6ZVN8 426 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 OTOP2Q7RTS6 562 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 SLC22A9Q8IVM8 553 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 CNPY4Q8N129 248 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 RAB42Q8N4Z0 105 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 GPR156Q8NFN8 814 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 DBF4BQ8NFT6 615 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 PIK3R5Q8WYR1 880 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 SERAC1Q96JX3 654 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ZFYVE19Q96K21 471 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 DGCR6LQ9BY27 220 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 PHACTR1Q9C0D0 580 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 DTLQ9NZJ0 730 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 BLOC1S6Q9UL45 172 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 LRCH1Q9Y2L9 728 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 VWA7Q9Y334 891 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 OR51F1A6NGY5 319 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 RAD51BO15315 384 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 HOXA2O43364 376 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 HS6ST1O60243 411 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 BPGMP07738 259 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 CSH1P0DML2 217 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 CSH2P0DML3 217 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 MSH3P20585 1137 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 PSMB9P28065 219 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 CCT8P50990 548 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 RAB10P61026 200 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 LSM3P62310 102 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms