RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 CXCR2P25025 360 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 PCID2Q5JVF3 399 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 TRPV3Q8NET8 790 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 GPR152Q8TDT2 470 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 LPPQ93052 612 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 VPS4AQ9UN37 437 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 ACKR2O00590 384 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 RPL9P32969 192 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 STX12Q86Y82 276 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 DAW1Q8N136 415 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 ASB7Q9H672 318 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 UBE2QL1A1L167 161 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 OR5F1O95221 314 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF549Q6P9A3 640 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 CAB39LQ9H9S4 337 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 PAEPP09466 180 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 HECTD3Q5T447 861 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 SOCS4Q8WXH5 440 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 NEK6Q9HC98 313 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 OR10H3O60404 316 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 ACAP1Q15027 740 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 WDR59Q6PJI9 974 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 NAT16Q8N8M0 369 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 OR4A15Q8NGL6 344 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 BTBD7Q9P203 1132 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 HES2Q9Y543 173 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 SCGNO76038 276 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 KDELR1P24390 212 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 AKT2P31751 481 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 FBXO42Q6P3S6 717 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF540Q8NDQ6 660 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 HELQQ8TDG4 1101 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 UBE2E3Q969T4 207 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 C1orf50Q9BV19 199 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 FNDC11Q9BVV2 318 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 BRD9Q9H8M2 597 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 CDK7P50613 346 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 LIN54Q6MZP7 749 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF558Q96NG5 402 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 TGFB3P10600 412 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 CDC25CP30307 473 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 DNAJC18Q9H819 358 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 CEP68Q76N32 757 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF248Q8NDW4 579 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 TRIM39Q9HCM9 518 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 LGALS2P05162 132 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 LINC00032P0C843 101 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 ERVK-9P63128 1117 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 SLC25A3Q00325 362 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 ARPINQ7Z6K5 226 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 ITPKBP27987 946 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 MAXP61244 160 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 GRB14Q14449 540 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 SPESP1Q6UW49 350 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC182A6NF36 153 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 BTN3A3O00478 584 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 KPNA5O15131 536 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 PRODHO43272 600 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 SLC28A2O43868 658 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 CHRNGP07510 517 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 SPATA31D3P0C874 917 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 PTPN5P54829 565 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF844Q08AG5 666 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 CDYL2Q8N8U2 506 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 MYLPFQ96A32 169 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED3-201ENST00000255198 CDADC1Q9BWV3 514 aa20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms