RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 GBP4Q96PP9 640 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 ERGIC2Q96RQ1 377 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 USP29Q9HBJ7 922 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 EPHB2P29323 1055 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 ABL2P42684 1182 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 AIF1P55008 147 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 FZD2Q14332 565 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 STX1AQ16623 288 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 GDPD4Q6W3E5 623 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 LEKR1Q6ZMV7 388 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 MON1BQ7L1V2 547 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 TTC7BQ86TV6 843 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 PARGQ86W56 976 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 FAM181AQ8N9Y4 354 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 DENND6BQ8NEG7 585 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 APOLD1Q96LR9 279 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 TTYH3Q9C0H2 523 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 ASXL3Q9C0F0 2248 aa21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 RRP8O43159 456 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 NME1P15531 152 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 DESP17661 470 aa21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 ABCG1P45844 678 aa21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 PYROXD2Q8N2H3 581 aa21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 EPAS1Q99814 870 aa21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 K7ESM1 405 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 CCP110O43303 1012 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 CREB3O43889 395 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 TMCC1O94876 653 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 IGSF6O95976 241 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 GP1BAP07359 652 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 DCUN1D2Q6PH85 259 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 KDM7AQ6ZMT4 941 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 BTN2A2Q8WVV5 523 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 BAP1Q92560 729 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 CNPY3Q9BT09 278 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 DONSONQ9NYP3 566 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 FZD10Q9ULW2 581 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 WASH4PA8MWX3 477 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 AREL1O15033 823 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 OPA1O60313 960 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 NEBLO76041 1014 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 FERP16591 822 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 ACTN2P35609 894 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 PFN3P60673 137 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 RHOAP61586 193 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 PTK2BQ14289 1009 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 PARP15Q460N3 678 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 ACAD10Q6JQN1 1059 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 FGF11Q92914 225 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 VOPP1Q96AW1 172 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 CENPTQ96BT3 561 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 MCEEQ96PE7 176 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 ABCG4Q9H172 646 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 CAAP1Q9H8G2 361 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 GGT7Q9UJ14 662 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 ITM2BQ9Y287 266 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 ITPR1Q14643 2758 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 RASA4BC9J798 803 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 AQP9O43315 295 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 RASA4O43374 803 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 TM7SF2O76062 418 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 JUNDP17535 347 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 THOP1P52888 689 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 YPEL5P62699 121 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 SERINC3Q13530 473 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 NFKBIBQ15653 356 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 CDCP2Q5VXM1 449 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 CXorf40AQ8TE69 158 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 VCPIP1Q96JH7 1222 aa21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 DEPDC7Q96QD5 511 aa21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms