RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 APOEP02649 317 aa16.71■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 PRKAR1AP10644 381 aa16.71■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CMA1P23946 247 aa16.71■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 GRNP28799 593 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 OAS2P29728 719 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 IGFALSP35858 605 aa16.71■□□□□ 0.27
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SPCS1-201ENST00000233025 SLC35F5Q8WV83 523 aa16.7■□□□□ 0.26
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SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R9BQ96SB3 815 aa16.7■□□□□ 0.26
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SPCS1-201ENST00000233025 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
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SPCS1-201ENST00000233025 MAP9Q49MG5 647 aa16.67■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 ZCWPW2Q504Y3 356 aa16.67■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 LCLAT1Q6UWP7 414 aa16.67■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 GKN2Q86XP6 184 aa16.67■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 RCBTB1Q8NDN9 531 aa16.67■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 CPT1CQ8TCG5 803 aa16.67■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA32Q96LK8 384 aa16.67■□□□□ 0.26
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