RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 SIN3BO75182 1162 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 PMPCBO75439 489 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 ZMPSTE24O75844 475 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 DXOO77932 396 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 IRF1P10914 325 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 PAMP19021 973 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 HLA-DPA1P20036 260 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 DNAJB1P25685 340 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 CRHR1P34998 444 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 CA8P35219 290 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 HADHAP40939 763 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 CD86P42081 329 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 ETV4P43268 484 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 MAGEA12P43365 314 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 POLD2P49005 469 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 LIMK2P53671 638 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 ZXDBP98169 803 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 DSC2Q02487 901 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 LAMB3Q13751 1172 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF235Q14590 738 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC1A5Q15758 541 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 PDK4Q16654 411 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 CTC1Q2NKJ3 1217 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 RALGPS1Q5JS13 557 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 PPM1LQ5SGD2 360 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 STXBP5Q5T5C0 1151 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 PLPP4Q5VZY2 271 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 IL31Q6EBC2 164 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 PIGWQ7Z7B1 504 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 CPLX4Q7Z7G2 160 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 RASSF3Q86WH2 238 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 LRRC34Q8IZ02 419 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 OR52K2Q8NGK3 314 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 TCP10LQ8TDR4 215 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 MFSD3Q96ES6 412 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 FEM1CQ96JP0 617 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 CYP2S1Q96SQ9 504 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 ATXN3LQ9H3M9 355 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 UGT1A7Q9HAW7 530 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 UGT1A10Q9HAW8 530 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 UGT1A8Q9HAW9 530 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 CHRAC1Q9NRG0 131 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 TREX1Q9NSU2 369 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 TXNDC16Q9P2K2 825 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 DPP7Q9UHL4 492 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 OR51B4Q9Y5P0 310 aa9.65□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 TCP11X1B4DZS4 312 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 COPEO14579 308 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 MUSKO15146 869 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 TIMM44O43615 452 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 PAPLNO95428 1278 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 FGF1P05230 155 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 CKMP06732 381 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 ITGA2BP08514 1039 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 VIMP08670 466 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 SERPINF2P08697 491 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 ERVK-10P10266 1014 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 TCF3P15923 654 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 PTPN2P17706 415 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 TPH1P17752 444 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 CR2P20023 1033 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 TAC1P20366 129 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 NMBRP28336 390 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 SPRP35270 261 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 CCT5P48643 541 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 SGSHP51688 502 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 MAXP61244 160 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 CYP4F8P98187 520 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 CDK18Q07002 472 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 ITKQ08881 620 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 CAMK1Q14012 370 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 IHHQ14623 411 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 DBN1Q16643 649 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 UGP2Q16851 508 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 INSCQ1MX18 579 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 MPPE1Q53F39 396 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 HHATQ5VTY9 493 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 FYB2Q5VWT5 728 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 LVRNQ6Q4G3 990 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 CES3Q6UWW8 571 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 MICALCLQ6ZW33 695 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 KCNMB4Q86W47 210 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 UNC5BQ8IZJ1 945 aa9.64□□□□□ -0.87
APOBEC1-201ENST00000229304 KIAA1958Q8N8K9 716 aa9.64□□□□□ -0.87
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