RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 F11P03951 625 aa24.2■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 CNPP09543 421 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC15Q0P6D6 951 aa24.2■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 C16orf59Q7L2K0 433 aa24.2■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR22Q99680 433 aa24.2■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 MCMBPQ9BTE3 642 aa24.2■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 ASB3Q9Y575 518 aa24.2■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 LILRB3O75022 631 aa24.2■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 SERPINF2P08697 491 aa24.2■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 GRM3Q14832 879 aa24.2■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC153Q494R4 210 aa24.2■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 RAPH1Q70E73 1250 aa24.2■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 WBP2Q969T9 261 aa24.2■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 MUC3BQ9H195 1237 aa24.2■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 RASSF4Q9H2L5 321 aa24.2■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 MUSKO15146 869 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 TGM5O43548 720 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 LATS1O95835 1130 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 LRG1P02750 347 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 HDCP19113 662 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 SAT1P21673 171 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 ARNTP27540 789 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 CDK18Q07002 472 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 CTBP1Q13363 440 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 TSTD2Q5T7W7 516 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 DENND6AQ8IWF6 608 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 FEM1CQ96JP0 617 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 C7orf26Q96N11 449 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 TLK1Q9UKI8 766 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A0G2JND7 137 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 FGBP02675 491 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 AHSGP02765 367 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 HLA-DPA1P20036 260 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 STX3Q13277 289 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 IHHQ14623 411 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 USP10Q14694 798 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 TXNDC8Q6A555 127 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF470Q6ECI4 717 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 NLRP9Q7RTR0 991 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 TMC7Q7Z402 723 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 RFWD2Q8NHY2 731 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 CALML6Q8TD86 181 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 TSNARE1Q96NA8 513 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM216Q9P0N5 145 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa24.19■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 OBSL1O75147 1896 aa24.18■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 CBX4O00257 560 aa24.18■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 GJB3O75712 270 aa24.18■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 PROCP04070 461 aa24.18■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 C2P06681 752 aa24.18■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 GABRR2P28476 465 aa24.18■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 MPP1Q00013 466 aa24.18■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 DLG2Q15700 870 aa24.18■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 GALNTL6Q49A17 601 aa24.18■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 NEPROQ6NW34 567 aa24.18■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 TTC16Q8NEE8 873 aa24.18■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC22A12Q96S37 553 aa24.18■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 MGME1Q9BQP7 344 aa24.18■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 H0Y626 953 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 CXCL14O95715 111 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 FGF1P05230 155 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 GLDCP23378 1020 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC1A2P43004 574 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 ALG1LQ6GMV1 187 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 KLHL23Q8NBE8 558 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 PSKH2Q96QS6 385 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 IL21Q9HBE4 155 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 STOML2Q9UJZ1 356 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 INSL6Q9Y581 213 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 ACTL7AQ9Y615 435 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 CPQQ9Y646 472 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 SIN3BO75182 1162 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 C1RP00736 705 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 EPOP01588 193 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 ADH1AP07327 375 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNA4P22459 653 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 ARFIP2P53365 341 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 LAMB3Q13751 1172 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC149Q6ZUS6 474 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 CRLF3Q8IUI8 442 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 ERP27Q96DN0 273 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 CHKBQ9Y259 395 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa24.17■■□□□ 1.46
RPUSD1-201ENST00000007264 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms