RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrc42Q8R2U7 421 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Barhl2Q8VIB5 384 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf19bA2A7Q9 732 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10717D3Z1I8 228 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr731F8VQB9 326 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scamp3O35609 349 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adcy1O88444 1118 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klc1O88447 541 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wnt3aP27467 352 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gna12P27600 379 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cxcl12P40224 93 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HpcaP84075 193 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aqp1Q02013 269 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf800Q0VEE6 662 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nt5dc3Q3UHB1 546 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 1810049J17RikQ3V2G9 153 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krt75Q8BGZ7 551 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc63Q8CDV6 558 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mgat5Q8R4G6 740 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mtmr14Q8VEL2 648 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CrygnQ8VHL5 183 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snx15Q91WE1 337 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nudt8Q9CR24 210 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Efhc2Q9D485 750 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PrccQ9EQC8 491 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trip4Q9QXN3 581 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mzf1S4R1L6 814 aa12.94□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cntnap3E9PY62 1287 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm379J3QQ19 296 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp27b1O35084 507 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CenpcP49452 906 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CamkmtQ3U2J5 323 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adora2bQ60614 332 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem45aQ60774 273 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cfap97Q6ZPR1 541 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Elmo1Q8BPU7 727 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mab21L3Q8CI17 429 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr742A2RTP5 311 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trim12cD3Z3L3 497 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r11E9Q4X4 861 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gjd2O54851 321 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd36Q08857 472 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ak8Q32M07 479 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Larp4bQ6A0A2 741 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rmnd5aQ80YQ8 391 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ubp1Q811S7 540 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf784Q8BI69 297 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tcf25Q8R3L2 676 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr693Q8VF89 316 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp617Q91WM0 559 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdhgb1Q91XX8 918 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atg13Q91YI1 516 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gprc5bQ923Z0 410 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nkd1Q99MH6 471 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hddc3Q9D114 179 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kctd4Q9D7X1 259 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vps35Q9EQH3 796 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Htra2Q9JIY5 458 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PollQ9QXE2 573 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Iqca1lA6H690 825 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acp4D3YTS9 425 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam151bD3YUE4 279 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adamts6D3Z1A5 1117 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r39G3UWE6 305 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pabpc1P29341 636 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Faf2Q3TDN2 445 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc17a7Q3TXX4 560 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HecaQ3V1N5 544 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abcd2Q61285 741 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trappc6aQ78XR0 159 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1355Q7TQU9 310 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RragdQ7TT45 449 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gxylt2Q810K9 444 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc39a13Q8BZH0 361 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Asz1Q8VD46 475 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr342Q8VGK7 312 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dach2Q925Q8 634 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Coro7Q9D2V7 922 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9D454 513 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc97Q9DBT3 340 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Jph2Q9ET78 696 aa12.93□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3259D3YUK0 475 aa12.92□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Grip2G3XA20 1042 aa12.92□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DcxO88809 366 aa12.92□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa12.92□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sp140Q6NSQ5 534 aa12.92□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r26Q6TAC4 855 aa12.92□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cpsf4Q8BQZ5 211 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kirrel3Q8BR86 778 aa12.92□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hdac7Q8C2B3 938 aa12.92□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snx30Q8CE50 437 aa12.92□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr55Q9CX97 388 aa12.92□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf146Q9CZW6 359 aa12.92□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adgrf4Q9D2L6 698 aa12.92□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam3aQ9D8T0 230 aa12.92□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 QkiQ9QYS9 341 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pdpk1Q9Z2A0 559 aa12.92□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm44511A0A0N4SW10 223 aa12.92□□□□□ -0.34
Pkp1-201ENSMUST00000027667 C2cd2E9Q3C1 696 aa12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.5 ms