RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 CPXM2Q8N436 756 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 HLA-CQ95604 372 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 WNT6Q9Y6F9 365 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 HACD1B0YJ81 288 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 GFRA2O00451 464 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 MBTPS2O43462 519 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 MFSD11O43934 449 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 TPGS1Q6ZTW0 290 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 NPWQ8N729 165 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 BPIFB1Q8TDL5 484 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 BHMTQ93088 406 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 USH1CQ9Y6N9 552 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN8-208ENST00000635751 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 GOLGA8RI6L899 631 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 LRRN4Q8WUT4 740 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 P2RY11Q96G91 374 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 APOPT1Q96IL0 206 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 VPS11Q9H270 941 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 DTLQ9NZJ0 730 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 ZNF180Q9UJW8 692 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 MYO10Q9HD67 2058 aa20.26■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 WASH4PA8MWX3 477 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 TBL1XO60907 577 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 METTL18O95568 372 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 PRKCHP24723 683 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 MAGEA3P43357 314 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 SLC18A2Q05940 514 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 LRRC6Q86X45 466 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 DDI1Q8WTU0 396 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 OBP2AQ9NY56 170 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 MGRN1O60291 552 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 C1QAP02745 245 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 CDH4P55283 916 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 SEMA5AQ13591 1074 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 SETDB1Q15047 1291 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 SNCBQ16143 134 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 FAM182AQ5T1J6 154 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 PARM1Q6UWI2 310 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 VITQ6UXI7 678 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 TMEM25Q86YD3 366 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 FGF14Q92915 247 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 SERAC1Q96JX3 654 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 OLFM3Q96PB7 478 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 KXD1Q9BQD3 176 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 PLK2Q9NYY3 685 aa20.25■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 DCTN3O75935 186 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 KRT37O76014 449 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 ALDH3A1P30838 453 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 OR1E1P30953 314 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 SERPINB6P35237 376 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 NEK3P51956 506 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 MPPE1Q53F39 396 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 LGSNQ5TDP6 509 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 FYB2Q5VWT5 728 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 TRIM68Q6AZZ1 485 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 CTAGE3PQ8IX95 158 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 PPM1NQ8N819 430 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 E2F7Q96AV8 911 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 OTUB2Q96DC9 234 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 ZFYVE19Q96K21 471 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 SLC17A7Q9P2U7 560 aa20.24■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 A0A1B0GVM2 712 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 CLDN11O75508 207 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 FAM155BO75949 473 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 FDFT1P37268 417 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 MNAT1P51948 309 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms