RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	FSCB	Q5H9T9	825 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	IFNL1	Q8IU54	200 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TSGA13	Q96PP4	275 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	HAPLN3	Q96S86	360 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	IL12RB2	Q99665	862 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	GABRQ	Q9UN88	632 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	NEMP2	A6NFY4	417 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM114	B3SHH9	223 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM233	B4DJY2	109 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152		M0QZQ0	153 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	PEX19	P40855	299 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	DLG1	Q12959	904 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	GRIK3	Q13003	919 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	MATN2	O00339	956 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CCL22	O00626	93 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CACNG3	O60359	315 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	DLX3	O60479	287 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF623	O75123	536 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	DDHD2	O94830	711 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	GRK4	P32298	578 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	NUDT2	P50583	147 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TAS2R39	P59534	338 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	RAB10	P61026	200 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ASPH	Q12797	758 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	KCNA10	Q16322	511 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	DRC3	Q9H069	523 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	DSE	Q9UL01	958 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	POMP	Q9Y244	141 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	AP3B1	O00203	1094 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TNFRSF10B	O14763	440 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	HDAC3	O15379	428 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	PSMD3	O43242	534 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	KPNA6	O60684	536 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TBX18	O95935	607 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CYBA	P13498	195 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CYP2C18	P33260	490 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	GEM	P55040	296 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CNST	Q6PJW8	725 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SNX32	Q86XE0	403 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CATSPER2	Q96P56	530 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	S100A14	Q9HCY8	104 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	NT5M	Q9NPB1	228 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152		A6NHS1	94 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152		J3KR12	359 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CABYR	O75952	493 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	LINGO3	P0C6S8	592 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	WNT3A	P56704	352 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CCNI	Q14094	377 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CSHL1	Q14406	222 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	UGP2	Q16851	508 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	STYX	Q8WUJ0	223 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	MID2	Q9UJV3	735 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	IGHA2	P01877	340 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	APOA4	P06727	396 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ADRA1A	P35348	466 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	HADHA	P40939	763 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	FLT3LG	P49771	235 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	RAB27A	P51159	221 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	PLK1	P53350	603 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SLC12A2	P55011	1212 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		13.24	□□□□□ -0.29

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