RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 GJB3O75712 270 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 ECEL1O95672 775 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 IGSF6O95976 241 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 GSRP00390 522 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 CTAGE8P0CG41 777 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 HOXB2P14652 356 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 ETS1P14921 441 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 NTSR1P30989 418 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 ACTN2P35609 894 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 SCNN1BP51168 640 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 DR1Q01658 176 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 FZD5Q13467 585 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1R7Q15435 360 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 P3H1Q32P28 736 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 CARD16Q5EG05 197 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 PKN3Q6P5Z2 889 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 PID1Q7Z2X4 250 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 PRUNE1Q86TP1 453 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 CTAGE6Q86UF2 777 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 CTAGE4Q8IX94 777 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF567Q8N184 647 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 CNTD1Q8N815 330 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 OR2AP1Q8NGE2 309 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 OR6K2Q8NGY2 324 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC110Q8TBZ0 833 aa8.64□□□□□ -1.03
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SGMS1-211ENST00000626236 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 SPATA13Q96N96 652 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 RUNDC3BQ96NL0 473 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 PSKH2Q96QS6 385 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 VAT1Q99536 393 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 MGME1Q9BQP7 344 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 CARD6Q9BX69 1037 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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SGMS1-211ENST00000626236 TRHDEQ9UKU6 1024 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.64□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 MUC3AQ02505 3323 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 C5orf60A6NFR6 353 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 INSIG1O15503 277 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 OPHN1O60890 802 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 ADAM23O75077 832 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 SIN3BO75182 1162 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 GCATO75600 419 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 GAS8O95995 478 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 KRT14P02533 472 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 DCNP07585 359 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 NFKB1P19838 968 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 GKP32189 559 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 RGRP47804 291 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
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SGMS1-211ENST00000626236 ENPP2Q13822 863 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 STARD3Q14849 445 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 EOGTQ5NDL2 527 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 C9orf64Q5T6V5 341 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 SRLQ86TD4 932 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 CHST14Q8NCH0 376 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 OR2A12Q8NGT7 310 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 PTPRN2Q92932 1015 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 RTP4Q96DX8 246 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 TEKT5Q96M29 485 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 NUDCD1Q96RS6 583 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 GABRG3Q99928 467 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 SEMA3CQ99985 751 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa8.63□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 L2HGDHQ9H9P8 463 aa8.63□□□□□ -1.03
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