RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 EMC1Q8N766 993 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 EPS8L1Q8TE68 723 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 HIC2Q96JB3 615 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 STK33Q9BYT3 514 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 TM6SF2Q9BZW4 377 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 NDFIP2Q9NV92 336 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 EVA1BQ9NVM1 165 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 OR12D3Q9UGF7 316 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 IGLON5A6NGN9 336 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 F8VZ95 297 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 TSPAN6O43657 245 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 C1QL1O75973 258 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 DXOO77932 396 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 ADRA1BP35368 520 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 ETFBP38117 255 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 SGCGQ13326 291 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 DPCR1Q3MIW9 517 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 RAB6CQ53S08 254 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 LSMEM2Q8N112 164 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF248Q8NDW4 579 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 ASB12Q8WXK4 309 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 RAB7BQ96AH8 199 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 RAB6CQ9H0N0 254 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 ABCG4Q9H172 646 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 OSBPL2Q9H1P3 480 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 RETREG1Q9H6L5 497 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 KLF15Q9UIH9 416 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 C16orf96A6NNT2 1141 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 H3BM21 787 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 PES1O00541 588 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 FPGTO14772 594 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 USP12O75317 370 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 CSO75390 466 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 GKP32189 559 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 ABL2P42684 1182 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 LSSP48449 732 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 GABREP78334 506 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 NLRP14Q86W24 1093 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 IFI44Q8TCB0 444 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 VOPP1Q96AW1 172 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 LGMNQ99538 433 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 SPINT1O43278 529 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 RHOQP17081 205 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 MAPKAPK2P49137 400 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 ARL13BQ3SXY8 428 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC14Q49A88 953 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF805Q5CZA5 627 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 TPRG1LQ5T0D9 272 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF677Q86XU0 584 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 OR6K2Q8NGY2 324 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 MAPK15Q8TD08 544 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 CLSTN2Q9H4D0 955 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM248Q9NWD8 314 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 GGT7Q9UJ14 662 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PTPRF-216ENST00000617451 CHD5Q8TDI0 1954 aa25.33■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 FAM72CH0Y354 149 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 AQP9O43315 295 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 GSRP00390 522 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 JUNDP17535 347 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 MMP8P22894 467 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 ERVPABLB-1P60509 514 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 PFN3P60673 137 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 CDO1Q16878 200 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 FAM72AQ5TYM5 149 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 FAM72DQ6L9T8 149 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 FAM72BQ86X60 149 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 DENND6BQ8NEG7 585 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 OR2AP1Q8NGE2 309 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 SLC20A1Q8WUM9 679 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 RXFP2Q8WXD0 754 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEH1Q9H213 219 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 DNAI1Q9UI46 699 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 SALL4Q9UJQ4 1053 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 NEU3Q9UQ49 428 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 ITM2BQ9Y287 266 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 NEMP1O14524 444 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 SDC4P31431 198 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 CXADRP78310 365 aa25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms