RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 CXCL17Q6UXB2 119 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 AGMOQ6ZNB7 445 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 RAPH1Q70E73 1250 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 BHLHA9Q7RTU4 235 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 CLEC14AQ86T13 490 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC7BQ86TV6 843 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 C10orf107Q8IVU9 208 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 SCUBE1Q8IWY4 988 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 UNC5BQ8IZJ1 945 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF169Q8NCN4 708 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 GIPC2Q8TF65 315 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAJC9Q8WXX5 260 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 RSPH1Q8WYR4 309 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 JADE3Q92613 823 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 FATE1Q969F0 183 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 VPS39Q96JC1 886 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 SUSD3Q96L08 255 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM161BQ96MY7 647 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNK16Q96T55 309 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 GPR22Q99680 433 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC106Q9BWC9 280 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 FSD1LQ9BXM9 530 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 TRPV6Q9H1D0 765 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 VCX3BQ9H321 246 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 RUBCNLQ9H714 662 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 NMRAL1Q9HBL8 299 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 GLOD4Q9HC38 313 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 TAS2R1Q9NYW7 299 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 ARMCX1Q9P291 453 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC17A6Q9P2U8 582 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF212Q9UDV6 495 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAJB4Q9UDY4 337 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 NR2E3Q9Y5X4 410 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 PSAT1Q9Y617 370 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A087X1B8 175 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 MYADML2A6NDP7 307 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 H0Y3Z8 333 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 MATN3O15232 486 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 CACNG3O60359 315 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM13O60858 407 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 USP12O75317 370 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 FKBP6O75344 327 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ENTPD5O75356 428 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP6V1C1P21283 382 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 CRABP2P29373 138 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 CD52P31358 61 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SERPINB5P36952 375 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 GRIK1P39086 918 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC5A3P53794 718 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 CACNA2D1P54289 1103 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC12A2P55011 1212 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 AP2B1P63010 937 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 KDSRQ06136 332 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC12A1Q13621 1099 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 LAMB3Q13751 1172 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ITGA9Q13797 1035 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 DSC3Q14574 896 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 RABGAP1LQ5R372 815 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 C1orf146Q5VVC0 180 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 RGMBQ6NW40 437 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 C16orf46Q6P387 395 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 GLB1LQ6UWU2 654 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ZYG11AQ6WRX3 759 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 KIAA0408Q6ZU52 694 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 CNTN4Q8IWV2 1026 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ULK2Q8IYT8 1036 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC8Q8TAM2 541 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 CALML6Q8TD86 181 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF570Q96NI8 536 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 PKMYT1Q99640 499 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 IL12RB2Q99665 862 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 GORASP1Q9BQQ3 440 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-222ENST00000592408 RTP3Q9BQQ7 232 aa9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms