RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLON5A6NGN9 336 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA8SH3BPF8 625 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 GKP32189 559 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 BPIFB4P59827 614 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 BECN1Q14457 450 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB133Q30KQ1 61 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP40Q5TG30 622 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF3Q5VWG9 929 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6K2Q8NGY2 324 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNE4Q8WWG9 221 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM59LQ9UK28 342 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 SATB2Q9UPW6 733 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 CPED1A4D0V7 1026 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 FPGTO14772 594 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 AQP9O43315 295 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 JUNDP17535 347 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 ACVRL1P37023 503 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 RAPGEF1Q13905 1077 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 CAMK4Q16566 473 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 MAN2A1Q16706 1144 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 C3orf38Q5JPI3 329 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 LMX1AQ8TE12 382 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 VOPP1Q96AW1 172 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 VCPIP1Q96JH7 1222 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 NDFIP2Q9NV92 336 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM51Q9NW97 253 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 FHOD1Q9Y613 1164 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 KLK10O43240 276 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 UCNP55089 124 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 PFN3P60673 137 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 SGCGQ13326 291 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB6CQ53S08 254 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 CRTC1Q6UUV9 634 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 RBFAQ8N0V3 343 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB6CQ9H0N0 254 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 THSD1Q9NS62 852 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 C16orf96A6NNT2 1141 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPAN6O43657 245 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 RHDQ02161 417 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 MIIPQ5JXC2 388 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN30Q86W11 494 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 NDST4Q9H3R1 872 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 SALL4Q9UJQ4 1053 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 CASC3O15234 703 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP11AP98196 1134 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 PERM1Q5SV97 790 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 IGF2-ASQ6U949 168 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 EMC1Q8N766 993 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 DENND6BQ8NEG7 585 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB7BQ96AH8 199 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 MGAQ8IWI9 3026 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 PMS2P1A4D2B8 440 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 NEMP1O14524 444 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 TPP1O14773 563 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 LSM8O95777 96 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 NR0B2Q15466 257 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 VWA3BQ502W6 1294 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF805Q5CZA5 627 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 MANEALQ5VSG8 457 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 PLPP6Q8IY26 295 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 ASB12Q8WXK4 309 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 CPA5Q8WXQ8 436 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 IL12RB2Q99665 862 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 DPH1Q9BZG8 443 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 SEMA4CQ9C0C4 833 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPM6Q9BX84 2022 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 GCATO75600 419 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 MMEP08473 750 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 IGFALSP35858 605 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 NOMO3P69849 1222 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf61Q13536 156 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 NAA35Q5VZE5 725 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 LEKR1Q6ZMV7 388 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 ARCQ7LC44 396 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-211ENST00000590874 NLRP14Q86W24 1093 aa26.04■■□□□ 1.76
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