RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CPXM2	Q8N436	756 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ASB11	Q8WXH4	323 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIM4	Q9C037	500 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	GGA2	Q9UJY4	613 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	LRP4	O75096	1905 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	RP1	P56715	2156 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A1W2PPC4	97 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIM38	O00635	465 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KLRC4	O43908	158 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	EXOC3	O60645	756 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CYBB	P04839	570 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	MPO	P05164	745 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ITGAV	P06756	1048 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	GIMD1	P0DJR0	217 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	RALA	P11233	206 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	MYF5	P13349	255 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	VAV1	P15498	845 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ABCB4	P21439	1286 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	GLDC	P23378	1020 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC6A4	P31645	630 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	DRD3	P35462	400 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	HNF1B	P35680	557 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CHKA	P35790	457 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PSMD8	P48556	350 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	BCAT1	P54687	386 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ADPRH	P54922	357 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	C21orf59	P57076	290 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	NXPH1	P58417	271 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CST6	Q15828	149 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	MSMP	Q1L6U9	139 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	INAVA	Q3KP66	663 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PIGZ	Q86VD9	579 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	UNC93A	Q86WB7	457 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	DTX1	Q86Y01	620 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FGF11	Q92914	225 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	LGMN	Q99538	433 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	DUSP16	Q9BY84	665 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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