RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 CCSER1Q9C0I3 900 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ISCUQ9H1K1 167 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ABCG8Q9H221 673 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KCNH6Q9H252 994 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MVB12BQ9H7P6 319 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PREBQ9HCU5 417 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 INTS13Q9NVM9 706 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 NINJ2Q9NZG7 142 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 ASIC3Q9UHC3 531 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SLC7A8Q9UHI5 535 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MAD2L2Q9UI95 211 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 LCMT1Q9UIC8 334 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TSPYL4Q9UJ04 414 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CAMK2AQ9UQM7 478 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 HS3ST4Q9Y661 456 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 STON1Q9Y6Q2 735 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 USP19O94966 1318 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 XKRY2A2RUG3 117 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 SNTNA6NMZ2 147 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 BTBD19C9JJ37 291 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 E9PBE3 544 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 O00370 1275 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 ADAMTS3O15072 1205 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 GATMP50440 423 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 ATP12AP54707 1039 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PRRX1P54821 245 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 HUNKP57058 714 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 UBE3CQ15386 1083 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NTRK3Q16288 839 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KLHL38Q2WGJ6 581 aa3.13□□□□□ -1.91
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