RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570150.1

PKD1-238, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-238	ENST00000570150	CFAP58	Q5T655	872 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PKD1-238	ENST00000570150	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PKD1-238	ENST00000570150	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PKD1-238	ENST00000570150	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PKD1-238	ENST00000570150	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PKD1-238	ENST00000570150	KIAA1328	Q86T90	577 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PKD1-238	ENST00000570150	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PKD1-238	ENST00000570150	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PKD1-238	ENST00000570150	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PKD1-238	ENST00000570150	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PKD1-238	ENST00000570150	SNX19	Q92543	992 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PKD1-238	ENST00000570150	RMDN1	Q96DB5	314 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PKD1-238	ENST00000570150	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PKD1-238	ENST00000570150	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PKD1-238	ENST00000570150	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PKD1-238	ENST00000570150	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PKD1-238	ENST00000570150	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PKD1-238	ENST00000570150	DKK3	Q9UBP4	350 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PKD1-238	ENST00000570150	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PKD1-238	ENST00000570150	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	TSPAN6	O43657	245 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	FSBP	O95073	299 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	KRT10	P13645	584 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	DRD3	P35462	400 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	GRIA4	P48058	902 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	VAV2	P52735	878 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	AP1S1	P61966	158 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	FOXK2	Q01167	660 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	TFDP2	Q14188	446 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	ZNF235	Q14590	738 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	FAF2	Q96CS3	445 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	FEM1C	Q96JP0	617 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	PSKH2	Q96QS6	385 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	PDF	Q9HBH1	243 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150		A0A1W2PPC4	97 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	LRRD1	A4D1F6	860 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	NEBL	O76041	1014 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	CD160	O95971	181 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	AMPD1	P23109	780 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	KDELR1	P24390	212 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	SERPINA4	P29622	427 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	ARSE	P51690	589 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	CNTN1	Q12860	1018 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	SLC14A1	Q13336	389 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	AGBL4	Q5VU57	503 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	DAAM2	Q86T65	1068 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	BIRC7	Q96CA5	298 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	EDEM2	Q9BV94	578 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	KLC2	Q9H0B6	622 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	ARHGAP33	O14559	1287 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	SLC30A4	O14863	429 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	PJA2	O43164	708 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	LAT	O43561	262 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	CER1	O95813	267 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	CA4	P22748	312 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	CCNC	P24863	283 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	GJC1	P36383	396 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	NR2C2	P49116	596 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	ELP6	Q0PNE2	266 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	MARC1	Q5VT66	337 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	IQCH	Q86VS3	1027 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	SPC24	Q8NBT2	197 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	CAPN10	Q9HC96	672 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	SARDH	Q9UL12	918 aa		18.24	■□□□□ 0.51

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