RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	MYBL1	P10243	752 aa		22.14	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ADRB3	P13945	408 aa		22.14	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	GK	P32189	559 aa		22.14	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	GRK6	P43250	576 aa		22.14	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	SERINC3	Q13530	473 aa		22.14	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	22.14	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		22.14	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		22.14	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		22.14	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		22.14	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		22.14	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	GATA6	Q92908	595 aa		22.14	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF653	Q96CK0	615 aa		22.14	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	22.14	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		22.14	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC19	Q9H756	370 aa		22.14	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		22.14	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		22.14	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		22.14	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	22.14	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	BUB1	O43683	1085 aa		22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	TMCC1	O94876	653 aa		22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	C1QTNF9	P0C862	333 aa		22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PRLR	P16471	622 aa		22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	MIP	P30301	263 aa		22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	RXRG	P48443	463 aa		22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	TPI1	P60174	286 aa		22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBED6	P86452	979 aa		22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	STAT4	Q14765	748 aa		22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	MYLK3	Q32MK0	819 aa		22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	SAP25	Q8TEE9	199 aa		22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM11	Q96F44	468 aa		22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	LAMA5	O15230	3695 aa		22.13	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPRB	P23467	1997 aa		22.12	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		22.12	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC31A1	O15431	190 aa		22.12	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	AP1G1	O43747	822 aa		22.12	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	LRCH4	O75427	683 aa		22.12	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	22.12	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		22.12	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		22.12	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		22.12	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		22.12	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	KLK6	Q92876	244 aa		22.12	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	IQCD	Q96DY2	449 aa		22.12	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	22.12	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	22.12	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	22.12	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		22.12	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	CHD6	Q8TD26	2715 aa		22.11	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		22.11	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGEC1	O60732	1142 aa		22.11	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF8	O76064	485 aa		22.11	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDH8	O95206	1070 aa		22.11	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	GYPC	P04921	128 aa		22.11	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PROS1	P07225	676 aa		22.11	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	22.11	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	22.11	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	22.11	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		22.11	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		22.11	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	22.11	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	22.11	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	NETO2	Q8NC67	525 aa		22.11	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PDF	Q9HBH1	243 aa		22.11	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	22.11	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNK	Q9P0W0	207 aa		22.11	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		22.11	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	22.11	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	KRIT1	O00522	736 aa		22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	YKT6	O15498	198 aa		22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	SPINT1	O43278	529 aa		22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PRPSAP2	O60256	369 aa		22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPING1	P05155	500 aa		22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ABL2	P42684	1182 aa		22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	NDST2	P52849	883 aa		22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	FGL2	Q14314	439 aa		22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ST3GAL2	Q16842	350 aa		22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	AFMID	Q63HM1	303 aa		22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	OXR1	Q8N573	874 aa		22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	DONSON	Q9NYP3	566 aa		22.1	■■□□□ 1.13

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