RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	RASSF9	O75901	435 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PIAS2	O75928	621 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	USP1	O94782	785 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	LARGE1	O95461	756 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TOMM40	O96008	361 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	VIP	P01282	170 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TNNT1	P13805	278 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPN2	P17706	415 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	IL10	P22301	178 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SERPINA4	P29622	427 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	GP5	P40197	560 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	HADHA	P40939	763 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	HDAC4	P56524	1084 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	UBASH3A	P57075	661 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	UBXN2A	P68543	259 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PRAME	P78395	509 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	E2F1	Q01094	437 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT17	Q04695	432 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	AP1B1	Q10567	949 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGEF7	Q14155	803 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CRYM	Q14894	314 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	E2F5	Q15329	346 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	C10orf25	Q5T742	122 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SARM1	Q6SZW1	724 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CHST3	Q7LGC8	479 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	METTL23	Q86XA0	190 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP97	Q8IW35	865 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	MPP5	Q8N3R9	675 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	C3orf49	Q96BT1	292 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CIPC	Q9C0C6	399 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	USP44	Q9H0E7	712 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TASP1	Q9H6P5	420 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PDE7B	Q9NP56	450 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		2.96	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	GLOD5	A6NK44	160 aa		2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	C4orf47	A7E2U8	309 aa		2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	STX16	O14662	325 aa		2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	KLK10	O43240	276 aa		2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAM20	O43506	726 aa		2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFSF14	O43557	240 aa		2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB14	O43829	449 aa		2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SEC14L2	O76054	403 aa		2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC175	P0C221	793 aa		2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	T-ENOL	P0DO92	83 aa		2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TPH1	P17752	444 aa		2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXC8	P31273	242 aa		2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	LMAN1	P49257	510 aa		2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	HSD17B4	P51659	736 aa		2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP5C	P53041	499 aa		2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	LIMK1	P53667	647 aa		2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PSG6	Q00889	435 aa		2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	IL1RL1	Q01638	556 aa		2.96	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	2.96	□□□□□ -1.94

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