RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552009.1

GNPTAB-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-209ENST00000552009 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.29□□□□□ -1.24
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GNPTAB-209ENST00000552009 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.29□□□□□ -1.24
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GNPTAB-209ENST00000552009 RLN3Q8WXF3 142 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 CD101Q93033 1021 aa7.29□□□□□ -1.24
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GNPTAB-209ENST00000552009 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
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GNPTAB-209ENST00000552009 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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GNPTAB-209ENST00000552009 SCFD1Q8WVM8 642 aa7.28□□□□□ -1.24
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GNPTAB-209ENST00000552009 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-209ENST00000552009 JAKMIP2Q96AA8 810 aa7.28□□□□□ -1.24
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GNPTAB-209ENST00000552009 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 ATG13O75143 517 aa7.27□□□□□ -1.25
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GNPTAB-209ENST00000552009 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 WASP42768 502 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 MAGEA11P43364 429 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 IRF9Q00978 393 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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GNPTAB-209ENST00000552009 FOXL1Q12952 345 aa7.27□□□□□ -1.25
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