RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 MXI1P50539 228 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 CBWD6Q4V339 395 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 CBWD3Q5JTY5 395 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 CBWD5Q5RIA9 395 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 CCNJLQ8IV13 435 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 RNF34Q969K3 372 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 CENPTQ96BT3 561 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 TBATAQ96M53 351 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 SLC13A1Q9BZW2 595 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 MAGEF1Q9HAY2 307 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 VANGL2Q9ULK5 521 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 MTMR6Q9Y217 621 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 MED13Q9UHV7 2174 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 OTOGQ6ZRI0 2925 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 CALUO43852 315 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 CD82P27701 267 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 GTF2H1P32780 548 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 THOP1P52888 689 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 CCDC15Q0P6D6 951 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 LRMPQ12912 555 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 SGCGQ13326 291 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 AUHQ13825 339 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 TAF5Q15542 800 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 RABGAP1LQ5R372 815 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 PHF19Q5T6S3 580 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 C22orf39Q6P5X5 142 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 VPS36Q86VN1 386 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 SPATA20Q8TB22 786 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 VOPP1Q96AW1 172 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 CMKLR1Q99788 373 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 EXOC1Q9NV70 894 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 SERTAD1Q9UHV2 236 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 GPR34Q9UPC5 381 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 A0A0D9SEW6 157 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 PRR19A6NJB7 356 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 STMND1H3BQB6 276 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 PPP6R2O75170 966 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 FBXO21O94952 628 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 PRKAR1AP10644 381 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 ITGB7P26010 798 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 L1CAMP32004 1257 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 GKP32189 559 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 UGT1A3P35503 534 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 PPARDQ03181 441 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 ARHGAP44Q17R89 818 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 ALG11Q2TAA5 492 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 ALFQ53S48 1182 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 SPRED1Q7Z699 444 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 ATCAYQ86WG3 371 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 RCBTB1Q8NDN9 531 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 HSFY1Q96LI6 401 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 MUC3BQ9H195 1237 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 RDH14Q9HBH5 336 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 COX16Q9P0S2 106 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 DOLKQ9UPQ8 538 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 ACTL7AQ9Y615 435 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 HS3ST4Q9Y661 456 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 CHD5Q8TDI0 1954 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-230ENST00000551968 AP1G1O43747 822 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 CUTAO60888 179 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 OAS2P29728 719 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 DCTP40126 519 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 RPL34P49207 117 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 OXCT1P55809 520 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 ENPEPQ07075 957 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 PTK2BQ14289 1009 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 CNGA2Q16280 664 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 NFIL3Q16649 462 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 EFHC2Q5JST6 749 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 LRRC73Q5JTD7 316 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 TMEM270Q6UE05 265 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 MACC1Q6ZN28 852 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 HID1Q8IV36 788 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 DENND6BQ8NEG7 585 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 GPR156Q8NFN8 814 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 SSC4DQ8WTU2 575 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 KAT5Q92993 513 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 TMEM159Q96B96 161 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 PAGE5Q96GU1 130 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 PPP1R16AQ96I34 528 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 EDEM3Q9BZQ6 932 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-230ENST00000551968 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms