RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 RGRP47804 291 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 NPY2RP49146 381 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TMPRSS15P98073 1019 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CTBP1Q13363 440 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CAMK1Q14012 370 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PPM1JQ5JR12 505 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 GPR158Q5T848 1215 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 RANBP10Q6VN20 620 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PACS1Q6VY07 963 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CMC1Q7Z7K0 106 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 MFN1Q8IWA4 741 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
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CS-215ENST00000549143 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 IFT43Q96FT9 208 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TM6SF2Q9BZW4 377 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 MAGEH1Q9H213 219 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TMEM51Q9NW97 253 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
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CS-215ENST00000549143 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CLEC4EQ9ULY5 219 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CARNS1A5YM72 827 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CACNG3O60359 315 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 USP1O94782 785 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ALDH1A2O94788 518 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 MT-CO1P00395 513 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SP100P23497 879 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 FOXN2P32314 431 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CLCN4P51793 760 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PTPRCAPQ14761 206 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 RASA2Q15283 850 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TEAD2Q15562 447 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SPANXN3Q5MJ09 141 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 STEAP4Q687X5 459 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TMC8Q8IU68 726 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SPNS2Q8IVW8 549 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 DENND6AQ8IWF6 608 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 BANPQ8N9N5 519 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CCDC63Q8NA47 563 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ARRDC2Q8TBH0 407 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CENPTQ96BT3 561 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 RMDN1Q96DB5 314 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SGSM3Q96HU1 749 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SMIM14Q96QK8 99 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 APOL5Q9BWW9 433 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CAB39LQ9H9S4 337 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 NOD2Q9HC29 1040 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CHKBQ9Y259 395 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ASB3Q9Y575 518 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TRANK1O15050 2925 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PATJQ8NI35 1801 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 A0A0U1RQS6 177 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 K7ERQ8 282 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TPP1O14773 563 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PSMD3O43242 534 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 RFPL1O75677 317 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ASMTLO95671 621 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 RHOP08100 348 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 MMP2P08253 660 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ITGA2BP08514 1039 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 GSTA2P09210 222 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TYK2P29597 1187 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PBX2P40425 430 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 IFT88Q13099 833 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 MPP3Q13368 585 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 DLG2Q15700 870 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PCID2Q5JVF3 399 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PKN3Q6P5Z2 889 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CMTM8Q8IZV2 173 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ZNF276Q8N554 614 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 OR6P1Q8NGX9 317 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SH3RF2Q8TEC5 729 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CKAP2Q8WWK9 683 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 MECRQ9BV79 373 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 VPS11Q9H270 941 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SOX13Q9UN79 622 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 KCTD3Q9Y597 815 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 MAGEB16A2A368 324 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 LEFTY2O00292 366 aa8.52□□□□□ -1.05
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