RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546416.5

NR2C1-206, Transcript of nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, human

TSL 3

Gene NR2C1, Length 864 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NR2C1-206	ENST00000546416	LETM2	Q2VYF4	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	ZNF843	Q8N446	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	CCDC17	Q96LX7	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	CLMP	Q9H6B4	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	CWH43	Q9H720	699 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	MYH4	Q9Y623	1939 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	LAMA1	P25391	3075 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	CCP110	O43303	1012 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	ONECUT2	O95948	504 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	ERBB2	P04626	1255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	SCG2	P13521	617 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	HOXC8	P31273	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	CCT8	P50990	548 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	PDE6C	P51160	858 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	STAT2	P52630	851 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	MGAT3	Q09327	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	HTR4	Q13639	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	WTAP	Q15007	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	C12orf60	Q5U649	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	SARG	Q9BW04	601 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	NYAP2	Q9P242	653 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	CAND2	O75155	1236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	ZNF806	P0C7X5	589 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	MCC	P23508	829 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	SLC16A2	P36021	539 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	LIPA	P38571	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	INSC	Q1MX18	579 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	DEFB124	Q8NES8	71 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	PPTC7	Q8NI37	304 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	GLG1	Q92896	1179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	PHKB	Q93100	1093 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	EDEM2	Q9BV94	578 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	PTPN13	Q12923	2485 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416		A1L4Q6	167 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	SHISA7	A6NL88	538 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	ANHX	E9PGG2	379 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	PRDM1	O75626	825 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	RASSF9	O75901	435 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NR2C1-206	ENST00000546416	MBD4	O95243	580 aa		4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms