RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544760.1

KDM5A-210, Transcript of lysine demethylase 5A, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5A, Length 2,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5A-210ENST00000544760 HTRA1Q92743 480 aa20.09■□□□□ 0.81
KDM5A-210ENST00000544760 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
KDM5A-210ENST00000544760 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa20.08■□□□□ 0.81
KDM5A-210ENST00000544760 TSPAN9O75954 239 aa20.08■□□□□ 0.81
KDM5A-210ENST00000544760 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
KDM5A-210ENST00000544760 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
KDM5A-210ENST00000544760 PPP5CP53041 499 aa20.08■□□□□ 0.81
KDM5A-210ENST00000544760 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.08■□□□□ 0.81
KDM5A-210ENST00000544760 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
KDM5A-210ENST00000544760 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
KDM5A-210ENST00000544760 GLRX5Q86SX6 157 aa20.08■□□□□ 0.81
KDM5A-210ENST00000544760 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
KDM5A-210ENST00000544760 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.08■□□□□ 0.81
KDM5A-210ENST00000544760 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.08■□□□□ 0.81
KDM5A-210ENST00000544760 GIMAP1Q8WWP7 306 aa20.08■□□□□ 0.81
KDM5A-210ENST00000544760 BCL7BQ9BQE9 202 aa20.08■□□□□ 0.81
KDM5A-210ENST00000544760 SLA2Q9H6Q3 261 aa20.08■□□□□ 0.81
KDM5A-210ENST00000544760 C12orf4Q9NQ89 552 aa20.08■□□□□ 0.81
KDM5A-210ENST00000544760 NPAP1Q9NZP6 1156 aa20.08■□□□□ 0.81
KDM5A-210ENST00000544760 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa20.08■□□□□ 0.81
KDM5A-210ENST00000544760 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 ZBTB39O15060 712 aa20.08■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 HDAC3O15379 428 aa20.08■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 ZW10O43264 779 aa20.08■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 MMP10P09238 476 aa20.08■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 SERPINB10P48595 397 aa20.08■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 CLCNKBP51801 687 aa20.08■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 CYBRD1Q53TN4 286 aa20.08■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 CYP2R1Q6VVX0 501 aa20.08■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.08■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 NIPA2Q8N8Q9 360 aa20.08■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 CALN1Q9BXU9 219 aa20.08■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa20.08■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 CD300AQ9UGN4 299 aa20.08■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 SNTNA6NMZ2 147 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 APOC2P02655 101 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 PPP4CP60510 307 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 RACK1P63244 317 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 SLC13A2Q13183 592 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 SNX17Q15036 470 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 PAGE2BQ5JRK9 111 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 SNAP47Q5SQN1 464 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 OR2T34Q8NGX1 318 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 OR2T3Q8NH03 318 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 CANT1Q8WVQ1 401 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 TMEM216Q9P0N5 145 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 VWA7Q9Y334 891 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 NEMP1O14524 444 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 TOR1BO14657 336 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 GPC4O75487 556 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 DNAJB5O75953 348 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 CFHP08603 1231 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 BMP1P13497 986 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 CTF1Q16619 201 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 LYSMD2Q8IV50 215 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 DAW1Q8N136 415 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 ADAM32Q8TC27 787 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 AFG1LQ8WV93 481 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 MARK4Q96L34 752 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 GIMAP4Q9NUV9 329 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa20.07■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 PRORSD1PA6NEY8 169 aa20.06■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 USP17L10C9JJH3 530 aa20.06■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 UPK1BO75841 260 aa20.06■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 ALDH1A2O94788 518 aa20.06■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 NRLP54845 237 aa20.06■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 OGDHQ02218 1023 aa20.06■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 LAMC2Q13753 1193 aa20.06■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 DGUOKQ16854 277 aa20.06■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 SEL1L3Q68CR1 1132 aa20.06■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 CYS1Q717R9 158 aa20.06■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 DHFR2Q86XF0 187 aa20.06■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.06■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 C6orf229H3BNL8 230 aa20.05■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 MEIS2O14770 477 aa20.05■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 RAD51BO15315 384 aa20.05■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 MFN2O95140 757 aa20.05■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 PTTG1O95997 202 aa20.05■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 ROR1Q01973 937 aa20.05■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 UNC5BQ8IZJ1 945 aa20.05■□□□□ 0.8
KDM5A-210ENST00000544760 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms