RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534106.2

CHMP4A-208, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 5

Gene CHMP4A, Length 370 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-208ENST00000534106 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa3.16□□□□□ -1.9
CHMP4A-208ENST00000534106 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa3.16□□□□□ -1.9
CHMP4A-208ENST00000534106 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
CHMP4A-208ENST00000534106 PCDH15Q96QU1 1955 aa3.16□□□□□ -1.9
CHMP4A-208ENST00000534106 C2CD3Q4AC94 2353 aa3.16□□□□□ -1.9
CHMP4A-208ENST00000534106 NUP205Q92621 2012 aa3.15□□□□□ -1.9
CHMP4A-208ENST00000534106 HELZP42694 1942 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.9
CHMP4A-208ENST00000534106 WDR81Q562E7 1941 aa3.15□□□□□ -1.9
CHMP4A-208ENST00000534106 A0A1W2PQU0 124 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 TTC26A0AVF1 554 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ARHGEF35A5YM69 484 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF840PA6NDX5 716 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ENO4A6NNW6 628 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CAPN14A8MX76 684 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 E9PAM4 449 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ACOT7O00154 380 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 PIRO00625 290 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC16A4O15374 487 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 PRODHO43272 600 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF217O75362 1048 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 RFPL3O75679 317 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 NOL4O94818 638 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 NFATC1O95644 943 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CER1O95813 267 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 MT-CO3P00414 261 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 WNT1P04628 370 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CISD3P0C7P0 127 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF883P0CG24 379 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 MCF2P10911 925 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 IFNAR1P17181 557 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 PROZP22891 400 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 NTSR1P30989 418 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ACSL1P33121 698 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ACTN2P35609 894 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 GRK6P43250 576 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 NAMPTP43490 491 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 NPTX2P47972 431 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ACADVLP49748 655 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 PGFP49763 221 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 TPMTP51580 245 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 GPR85P60893 370 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 TLE1Q04724 770 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 FOXL1Q12952 345 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 STK3Q13188 491 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 SERINC3Q13530 473 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 GRM7Q14831 915 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ANO4Q32M45 955 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 FUT11Q495W5 492 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 C9orf57Q5W0N0 161 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 JADE1Q6IE81 842 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 MOXD1Q6UVY6 613 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 IL27RAQ6UWB1 636 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 RABEPKQ7Z6M1 372 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 NEK8Q86SG6 692 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 OSTM1Q86WC4 334 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 NLGN4XQ8N0W4 816 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 DAW1Q8N136 415 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 D2HGDHQ8N465 521 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF248Q8NDW4 579 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 MCPH1Q8NEM0 835 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CCDC148Q8NFR7 591 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CCDC26Q8TAB7 109 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 SORCS1Q8WY21 1168 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 HIC2Q96JB3 615 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 VCPIP1Q96JH7 1222 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 IPPKQ9H8X2 491 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 EBF2Q9HAK2 575 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 TM9SF3Q9HD45 589 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 PARPBPQ9NWS1 579 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 PLK2Q9NYY3 685 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 PLA2G3Q9NZ20 509 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 DEC1Q9P2X7 70 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 LRWD1Q9UFC0 647 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 PCDHA12Q9UN75 941 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CPQQ9Y646 472 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 STK36Q9NRP7 1315 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 MTORP42345 2549 aa3.15□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 PTPRBP23467 1997 aa3.14□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa3.14□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 A0A1B0GTQ1 180 aa3.14□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa3.14□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 E2F8A0AVK6 867 aa3.14□□□□□ -1.91
CHMP4A-208ENST00000534106 PRAMEF25A6NGN4 478 aa3.14□□□□□ -1.91
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