RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 ATPAF2Q8N5M1 289 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 TCEAL3Q969E4 200 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 BIRC7Q96CA5 298 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 TFR2Q9UP52 801 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1B0GTW7 788 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 LRRD1A4D1F6 860 aa22.29■■□□□ 1.16
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PTPRK-222ENST00000532751 ITGB7P26010 798 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 VAV2P52735 878 aa22.29■■□□□ 1.16
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PTPRK-222ENST00000532751 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa22.29■■□□□ 1.16
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PTPRK-222ENST00000532751 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
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PTPRK-222ENST00000532751 OR6K2Q8NGY2 324 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 NETO1Q8TDF5 533 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 NSMCE1Q8WV22 266 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 RAPGEF5Q92565 580 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 FAF2Q96CS3 445 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF599Q96NL3 588 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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PTPRK-222ENST00000532751 LHX3Q9UBR4 397 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 ALG6Q9Y672 507 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 KRT1P04264 644 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 CD27P26842 260 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 CCR5P51681 352 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 NEK3P51956 506 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 IRX4P78413 519 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 GRM3Q14832 879 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 TMCO4Q5TGY1 634 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 TP53INP2Q8IXH6 220 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 BBS5Q8N3I7 341 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 EDEM2Q9BV94 578 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 PREBQ9HCU5 417 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 FRYLO94915 3013 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 ANKRD36A6QL64 1941 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 BTNL10A8MVZ5 291 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF487B1APH4 448 aa22.27■■□□□ 1.16
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PTPRK-222ENST00000532751 PLXNA2O75051 1894 aa22.27■■□□□ 1.16
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PTPRK-222ENST00000532751 ZNF805Q5CZA5 627 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 C11orf63Q6NUN7 778 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 FBXL19Q6PCT2 694 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 DAAM2Q86T65 1068 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRK-222ENST00000532751 EXOC2Q96KP1 924 aa22.27■■□□□ 1.16
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PTPRK-222ENST00000532751 A0A1W2PPC4 97 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 LNP1A1A4G5 178 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 RNF103O00237 685 aa22.26■■□□□ 1.15
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PTPRK-222ENST00000532751 GDF9O60383 454 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 SYPP08247 313 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 GKP32189 559 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 CSNK1DP48730 415 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
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PTPRK-222ENST00000532751 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 GDPD4Q6W3E5 623 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 TPCN2Q8NHX9 752 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 KLHL32Q96NJ5 620 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 RNF157Q96PX1 679 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 CAPN10Q9HC96 672 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 RCCD1A6NED2 376 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 MAFKO60675 156 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 ADRB3P13945 408 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 NUDT1P36639 197 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 LIMK1P53667 647 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 NEK5Q6P3R8 708 aa22.25■■□□□ 1.15
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