RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530756.1

BRMS1-208, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene BRMS1, Length 963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-208ENST00000530756 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 EXD3Q8N9H8 876 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 NETO2Q8NC67 525 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 DPH1Q9BZG8 443 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 TM6SF2Q9BZW4 377 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 CLPBQ9H078 707 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 WDCPQ9H6R7 721 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 RABGEF1Q9UJ41 708 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 BSNQ9UPA5 3926 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 DOCK4Q8N1I0 1966 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 SRGAP2O75044 1071 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 JUNDP17535 347 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 PON1P27169 355 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 OR1E1P30953 314 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 DNA2P51530 1060 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 CLCN6P51797 869 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 RPS21P63220 83 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 TCEA2Q15560 299 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 CARD16Q5EG05 197 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 KCTD16Q68DU8 428 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 CCDC114Q96M63 670 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 HEPHQ9BQS7 1158 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 LRRC61Q9BV99 259 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 DUSP23Q9BVJ7 150 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 BOCQ9BWV1 1114 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 USP29Q9HBJ7 922 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.88□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 C16orf96A6NNT2 1141 aa14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 IGFALSP35858 605 aa14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 ADKP55263 362 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 DEUP1Q05D60 604 aa14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 PAK1Q13153 545 aa14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 TGIF1Q15583 401 aa14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 BRMS1LQ5PSV4 323 aa14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 BNIPLQ7Z465 357 aa14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 DRC7Q8IY82 874 aa14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 CENPTQ96BT3 561 aa14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 MED8Q96G25 268 aa14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 FEM1CQ96JP0 617 aa14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 ATP13A1Q9HD20 1204 aa14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa14.87□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 BICDL2A1A5D9 508 aa14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 ILVBLA1L0T0 632 aa14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 AP1G1O43747 822 aa14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 NOBOXO60393 691 aa14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 TNFSF15O95150 251 aa14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 GNA14O95837 355 aa14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 HGFP14210 728 aa14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 RABIFP47224 123 aa14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 LINC00303Q3SY05 128 aa14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 PRRT3Q5FWE3 981 aa14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 CLEC14AQ86T13 490 aa14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 FAM131BQ86XD5 332 aa14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 XYLT1Q86Y38 959 aa14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 PPP1R16AQ96I34 528 aa14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 CCDC3Q9BQI4 270 aa14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 TRIM4Q9C037 500 aa14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 NEU3Q9UQ49 428 aa14.86□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 PTPN13Q12923 2485 aa14.85□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 FAM72CH0Y354 149 aa14.85□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 AGRPO00253 132 aa14.85□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 FPGTO14772 594 aa14.85□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 YY2O15391 372 aa14.85□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 SLC28A2O43868 658 aa14.85□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 TSHRP16473 764 aa14.85□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 NFKB2Q00653 900 aa14.85□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 GNA12Q03113 381 aa14.85□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 NR0B2Q15466 257 aa14.85□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa14.85□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 ARL13BQ3SXY8 428 aa14.85□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 SLC25A52Q3SY17 297 aa14.85□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
BRMS1-208ENST00000530756 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.9 ms