RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 GJB7Q6PEY0 223 aa4.49□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 SPPL3Q8TCT6 385 aa4.49□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 HSPH1Q92598 858 aa4.49□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 CDT1Q9H211 546 aa4.49□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa4.49□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa4.49□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 FBXO40Q9UH90 709 aa4.49□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 CNPY2Q9Y2B0 182 aa4.49□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 ACOT8O14734 319 aa4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 ADAP00813 363 aa4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 SERPINC1P01008 464 aa4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 ITGB8P26012 769 aa4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 AMTP48728 403 aa4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 PDLIM4P50479 330 aa4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 CAPSQ13938 189 aa4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 KEAP1Q14145 624 aa4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 ANKRD1Q15327 319 aa4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 HLFQ16534 295 aa4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 CHD1LQ86WJ1 897 aa4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 RBFAQ8N0V3 343 aa4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 SMRP1Q8NCR6 262 aa4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 GPT2Q8TD30 523 aa4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 TMED6Q8WW62 240 aa4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 LMLNQ96KR4 655 aa4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 PPCSQ9HAB8 311 aa4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 CD207Q9UJ71 328 aa4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 GDAQ9Y2T3 454 aa4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 RAI2Q9Y5P3 530 aa4.48□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 LINC01553A4QN01 128 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 PRSS44E7EML9 344 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 KLK10O43240 276 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 CLCN5P51795 746 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 ARSFP54793 590 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 ARL4CP56559 192 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 TRAF2Q12933 501 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 SLC12A1Q13621 1099 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 SHBQ15464 509 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 RPE65Q16518 533 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 SLC18A3Q16572 532 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 NCAPH2Q6IBW4 605 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 LURAP1LQ8IV03 231 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 TEX45Q8NA69 505 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 OR4N2Q8NGD1 307 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM163Q8TC26 289 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 TXNDC15Q96J42 360 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 SLC32A1Q9H598 525 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 MVB12BQ9H7P6 319 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 CD93Q9NPY3 652 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 OCIAD1Q9NX40 245 aa4.47□□□□□ -1.69
CPEB4-210ENST00000522344 CHL1O00533 1208 aa4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 KCNJ13O60928 360 aa4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 SERPINI2O75830 405 aa4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 FCGR1AP12314 374 aa4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 HALP42357 657 aa4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 ART1P52961 327 aa4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 RRP1P56182 461 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 IL20RBQ6UXL0 311 aa4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 CREB3L2Q70SY1 520 aa4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 HERC6Q8IVU3 1022 aa4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 LMO3Q8TAP4 145 aa4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 RNF183Q96D59 192 aa4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 MROH8Q9H579 483 aa4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 ALKBH4Q9NXW9 302 aa4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa4.46□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 VWA3AA6NCI4 1184 aa4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 SOX30O94993 753 aa4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 TFPIP10646 304 aa4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 CTPS1P17812 591 aa4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 CYP4A11Q02928 519 aa4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 SLC18A2Q05940 514 aa4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 NAA25Q14CX7 972 aa4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 EDRF1Q3B7T1 1238 aa4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 MON1AQ86VX9 555 aa4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 CLIP4Q8N3C7 705 aa4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 GDPD5Q8WTR4 605 aa4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 YME1L1Q96TA2 773 aa4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 LMAN2LQ9H0V9 348 aa4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 RASSF1Q9NS23 344 aa4.45□□□□□ -1.7
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM51Q9NW97 253 aa4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms