RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518916.5

MSC-AS1-204, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 864 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-204ENST00000518916 CD86P42081 329 aa14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 CYTH1Q15438 398 aa14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 SLC14A2Q15849 920 aa14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 GEN1Q17RS7 908 aa14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 NUDT18Q6ZVK8 323 aa14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 C12orf40Q86WS4 652 aa14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 PGBD5Q8N414 524 aa14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 IPMKQ8NFU5 416 aa14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 GTSE1Q9NYZ3 720 aa14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 UBP1Q9NZI7 540 aa14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 HS3ST2Q9Y278 367 aa14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-204ENST00000518916 PMPCBO75439 489 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 SUN1O94901 812 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 IGSF6O95976 241 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 CISD3P0C7P0 127 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 MLNP12872 115 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 MAPK8P45983 427 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 ST8SIA6P61647 398 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 GAB4Q2WGN9 574 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 BBS9Q3SYG4 887 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 RALGPS1Q5JS13 557 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 C22orf39Q6P5X5 142 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 ADIPOR2Q86V24 386 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 DNAAF3Q8N9W5 541 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 SPATA22Q8NHS9 363 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 TTC8Q8TAM2 541 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 UCMAQ8WVF2 138 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 TTC17Q96AE7 1141 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 EXOC2Q96KP1 924 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 SERPINB12Q96P63 405 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 NUDCD1Q96RS6 583 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 TBL1YQ9BQ87 522 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 FICDQ9BVA6 458 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 CEP44Q9C0F1 390 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 SAYSD1Q9NPB0 183 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 LHX3Q9UBR4 397 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa14.95□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 MUSKO15146 869 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 INSIG1O15503 277 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 TIMM44O43615 452 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 APODP05090 189 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 DLDP09622 509 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 SRCP12931 536 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 STK19P49842 368 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 SCNN1BP51168 640 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 PMS2P54278 862 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 WNT3AP56704 352 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 AP1S1P61966 158 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 NIPAL4Q0D2K0 466 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 E2F5Q15329 346 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 PCSK7Q16549 785 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 ACCSLQ4AC99 568 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 KCTD11Q693B1 232 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 LRRC8BQ6P9F7 803 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 MREGQ8N565 214 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 SH2D3CQ8N5H7 860 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 TERB1Q8NA31 727 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 DNASE1L2Q92874 299 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 LRRC39Q96DD0 335 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 IFT43Q96FT9 208 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 TTC25Q96NG3 672 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 TM6SF2Q9BZW4 377 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.94□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 K7ERQ8 282 aa14.93□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 ARNTLO00327 626 aa14.93□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 TRIM24O15164 1050 aa14.93□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 CD160O95971 181 aa14.93□□□□□ -0.02
MSC-AS1-204ENST00000518916 GSRP00390 522 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms