RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 STT3BQ8TCJ2 826 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 RIPOR3Q96MK2 946 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 NPAS1Q99742 590 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 CERS4Q9HA82 394 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 UPB1Q9UBR1 384 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 BAG5Q9UL15 447 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 PHTF1Q9UMS5 762 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 TCF19Q9Y242 345 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 LZTS1Q9Y250 596 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNX9Q9Y5X1 595 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A1B0GVY2 172 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 EFCAB8A8MWE9 144 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 VNN2O95498 520 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF883P0CG24 379 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF224P0DH78 156 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 LYL1P12980 280 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYP4B1P13584 511 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPR12P47775 334 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADORA2A-AS1P86434 159 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPS6KA2Q15349 733 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 FCN2Q15485 313 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 IZUMO3Q5VZ72 239 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 AADACL2Q6P093 401 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 SFR1Q86XK3 245 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 EPHX4Q8IUS5 362 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 KBTBD3Q8NAB2 608 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIB2Q92519 343 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARRDC3Q96B67 414 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIGSQ96S52 555 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 MSTO1Q9BUK6 570 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLPBQ9H078 707 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRFN1Q9P244 771 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLQ9UEF7 1012 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 C16orf97H3BN30 126 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 KDM4BO94953 1096 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 TFRCP02786 760 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 GYS1P13807 737 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 LIFRP42702 1097 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZBTB17Q13105 803 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 CAPSQ13938 189 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 LONRF1Q17RB8 773 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 DCAF6Q58WW2 860 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 GALNT7Q86SF2 657 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 BRSK2Q8IWQ3 736 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC105Q8IYK2 499 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF441Q8N8Z8 693 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR13A1Q8NGR1 328 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 RASSF8Q8NHQ8 419 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 STK33Q9BYT3 514 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRC4Q9HBW1 653 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR6C3Q9NZP0 311 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM90A18PA6NE21 464 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM90A16PA6NEW6 464 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 AQP12BA6NM10 295 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 APAF1O14727 1248 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 RASA4O43374 803 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLA2G6O60733 806 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLDN14O95500 239 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 IL1AP01583 271 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 AMBPP02760 352 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM90A15PP0C7V4 464 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM90A14PP0C7W9 464 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 DCTDP32321 178 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDKN1AP38936 164 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPS6KA3P51812 740 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBC1D9BQ66K14 1250 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 AADATQ8N5Z0 425 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR2C3Q8N628 320 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR1N1Q8NGS0 311 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIAA1191Q96A73 305 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 C3orf30Q96M34 536 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 MVB12BQ9H7P6 319 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 EBF2Q9HAK2 575 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC22A11Q9NSA0 550 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZFP57Q9NU63 452 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 VDAC3Q9Y277 283 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A0G2JPF8 293 aa2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms