RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 ELK3P41970 407 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PFKPQ01813 784 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ROR1Q01973 937 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PRKCEQ02156 737 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PDK2Q15119 407 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TPSAB1Q15661 275 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 STXBP2Q15833 593 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 INSCQ1MX18 579 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 BBS9Q3SYG4 887 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ARHGEF16Q5VV41 709 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SPOPLQ6IQ16 392 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 Q6ZS52 159 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CRLF3Q8IUI8 442 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PASD1Q8IV76 773 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 EXOC8Q8IYI6 725 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TTC39CQ8N584 583 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 DEPTORQ8TB45 409 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 FAM172AQ8WUF8 416 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 UCMAQ8WVF2 138 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TBCBQ99426 244 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 MSTO1Q9BUK6 570 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 HAPLN2Q9GZV7 340 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SDCBP2Q9H190 292 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SLC32A1Q9H598 525 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PRORYQ9H606 182 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 POPDC2Q9HBU9 364 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CISHQ9NSE2 258 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 RNF19AQ9NV58 838 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 THAP1Q9NVV9 213 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ASNSD1Q9NWL6 643 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SLC9A2Q9UBY0 812 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SOX13Q9UN79 622 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 C9IYK1 514 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TRIM49D1C9J1S8 452 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 H0Y626 953 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SLC22A2O15244 555 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ATP9BO43861 1147 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TOM1L1O75674 476 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ALDH1A2O94788 518 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TRIM16O95361 564 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ERBB2P04626 1255 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 RBP3P10745 1247 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 MLNP12872 115 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 GP1BBP13224 206 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 GRK2P25098 689 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 IL1R2P27930 398 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 L1CAMP32004 1257 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 GJC1P36383 396 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 GDF10P55107 478 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ACTR2P61160 394 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 NTHL1P78549 312 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CYP4F3Q08477 520 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 BST1Q10588 318 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ASPHQ12797 758 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 OVGP1Q12889 678 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CDC16Q13042 620 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 GNPTABQ3T906 1256 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 LIN52Q52LA3 116 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 C2CD6Q53TS8 623 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 RABGAP1LQ5R372 815 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 STEAP4Q687X5 459 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TAF2Q6P1X5 1199 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms