RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	THAP2	Q9H0W7	228 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	LHX3	Q9UBR4	397 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	DMTF1	Q9Y222	760 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZZEF1	O43149	2961 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014		J3KR12	359 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TLR4	O00206	839 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	INSIG1	O15503	277 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	BUB1	O43683	1085 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	DKK1	O94907	266 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYP1A2	P05177	515 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRLR	P16471	622 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERCC2	P18074	760 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCK1	P35558	622 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUDT1	P36639	197 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	NEK3	P51956	506 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	C21orf59	P57076	290 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	DPYS	Q14117	519 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYLK3	Q32MK0	819 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	RFX8	Q6ZV50	586 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	HORMAD1	Q86X24	394 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	IQCD	Q96DY2	449 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM11	Q96F44	468 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	FZD3	Q9NPG1	666 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	GGT7	Q9UJ14	662 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGF2R	P11717	2491 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC31A1	O15431	190 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	FLRT2	O43155	660 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	AP1G1	O43747	822 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRPSAP2	O60256	369 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRAMEF11	O60813	436 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCT8	P50990	548 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDST2	P52849	883 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	DPYSL2	Q16555	572 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	IQCH	Q86VS3	1027 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SAP25	Q8TEE9	199 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	DYRK4	Q9NR20	520 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLK13	Q9UKR3	277 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITM2B	Q9Y287	266 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		12.9	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRIT1	O00522	736 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	AREL1	O15033	823 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAD51B	O15315	384 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF8	O76064	485 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35

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