RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 GPANK1O95872 356 aa2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 RB1P06400 928 aa2.35□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 SELLP14151 372 aa2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 LAG3P18627 525 aa2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 DRD1P21728 446 aa2.35□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 NRIP1P48552 1158 aa2.35□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 TMF1P82094 1093 aa2.35□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 TYSND1Q2T9J0 566 aa2.35□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 C17orf99Q6UX52 265 aa2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa2.35□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 GLRX5Q86SX6 157 aa2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TADA2BQ86TJ2 420 aa2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 GPR135Q8IZ08 494 aa2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 NUP93Q8N1F7 819 aa2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 TSPAN14Q8NG11 270 aa2.35□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 TMEM79Q9BSE2 394 aa2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 ALG8Q9BVK2 526 aa2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 SIL1Q9H173 461 aa2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 CYP4F11Q9HBI6 524 aa2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 MRGBPQ9NV56 204 aa2.35□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 SEMA5BQ9P283 1151 aa2.35□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 RFXAPO00287 272 aa2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-218ENST00000509368 PER2O15055 1255 aa2.35□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 NOBOXO60393 691 aa2.35□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
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PDE4D-218ENST00000509368 CARNMT1Q8N4J0 409 aa2.35□□□□□ -2.03
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