RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503668.1

HULC-201, hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HULC, Length 556 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HULC-201ENST00000503668 PEX2P28328 305 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 HSPA1LP34931 641 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 HTR7P34969 479 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 ADH7P40394 386 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 TKTL1P51854 596 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 ART3Q13508 389 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 SLC12A1Q13621 1099 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 PRKG1Q13976 671 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 TTLL4Q14679 1199 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 CA9Q16790 459 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 RALGPS1Q5JS13 557 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 C1orf53Q5VUE5 145 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 C16orf46Q6P387 395 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 FRMD7Q6ZUT3 714 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 RFX8Q6ZV50 586 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 MAVSQ7Z434 540 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 DSELQ8IZU8 1212 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 MPP5Q8N3R9 675 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 DCLK2Q8N568 766 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 CEP70Q8NHQ1 597 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 P2RY11Q96G91 374 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 BIRC8Q96P09 236 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 GPR22Q99680 433 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 SPATC1LQ9H0A9 340 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 RHOJQ9H4E5 214 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 ZNF385DQ9H6B1 395 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 BRD7Q9NPI1 651 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 GDAP2Q9NXN4 497 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 HMGXB4Q9UGU5 601 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 SARDHQ9UL12 918 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 VANGL2Q9ULK5 521 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 TELO2Q9Y4R8 837 aa9.52□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 COL4A5P29400 1685 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 LRRC37A2A6NM11 1700 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 C9IYK1 514 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 F9P00740 461 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 C2P06681 752 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 C8BP07358 591 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 MYL3P08590 195 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 SMIM18P0DKX4 95 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 TFEBP19484 476 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 PMLP29590 882 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 AXLP30530 894 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 CYP2C18P33260 490 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 ATP4BP51164 291 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 GJA9P57773 515 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 NAA20P61599 178 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 DLG1Q12959 904 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 MPP3Q13368 585 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 APOFQ13790 326 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 ZBTB6Q15916 424 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 MDH1BQ5I0G3 518 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 LPCAT4Q643R3 524 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 RNF111Q6ZNA4 994 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 ARMCX2Q7L311 632 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 LIMS2Q7Z4I7 341 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 STRA8Q7Z7C7 330 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 HPS6Q86YV9 775 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 CNTN4Q8IWV2 1026 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 COLGALT2Q8IYK4 626 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 LRRC71Q8N4P6 559 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 POU5F2Q8N7G0 328 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 RNF139Q8WU17 664 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 STYXQ8WUJ0 223 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 PGBD4Q96DM1 585 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 ASB9Q96DX5 294 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 SPATA33Q96N06 139 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 UCN2Q96RP3 112 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 TRMOQ9BU70 441 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 TRIM62Q9BVG3 475 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 MROH8Q9H579 483 aa9.51□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms